Geeni
PPT1
palmitoyl-protein thioesterase 1
- HGNC 9325↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000131238↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 5538↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1p34.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 40 072 712–40 097 252 (GRCh38)
- Eksonit
- 9 eksonia 24,5 kb:n alueella
- Proteiini
- 306 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- CLN1, INCL
- Aiemmat symbolit
- PPT
- MANE Select -transkripti
- ENST00000642050.2NM_000310.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PPT1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Neuronaalinen keroidilipofustinoosi
- Autosomaalinen resessiivinen
Joukko perinnöllisiä, etenevästi rappeutuvia aivosairauksia, joille on kliinisesti tyypillistä henkisten ja muiden toimintojen heikkeneminen, epilepsia sekä verkkokalvon rappeutumisen aiheuttama näön heikkeneminen. Patologisesti niille on ominaista autofluoresoivan aineen, keroidilipofuskiinin, kertyminen solunsisäisesti aivojen ja verkkokalvon hermosoluihin.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 7 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Laajemmat ryhmät
Lysosomaalinen varastosairaus
- Lysosomaalinen kertymäsairaus (muut ja määrittelemättömät tyypit)
Yksi 59 siihen liittyvästä geenistä
Kattaa lysosomaaliset kertymäsairaudet, joilla ei ole omaa raporttia, kuten Farberin tauti ja muut ASAH1-geeniin liittyvät sairaudet, prosapsiini- (PSAP) -puutokset, multippeli sulfataasipuutos, mukopolysakkaridoosi tyypit IX ja X sekä Dorfman-Chanarinin tauti. Periytymistapa vaihtelee alatyypeittäin, useimmiten autosomaalisesti resessiivinen.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 7 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
PPT1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,3 kb geenin 24,5 kb:stä; 921 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PPT1
117
PPT1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 24,5 kb geenistä PPT1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,3 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Yhteisiä sairauksia: 2
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninYhteisiä sairauksia: 2
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseYhteisiä sairauksia: 2
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinYhteisiä sairauksia: 2
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinYhteisiä sairauksia: 2
- CTSDcathepsin DYhteisiä sairauksia: 2
- CTSFcathepsin FYhteisiä sairauksia: 2
- DNAJC5DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5Yhteisiä sairauksia: 2
- GRNgranulin precursorYhteisiä sairauksia: 2
- KCTD7potassium channel tetramerization domain containing 7Yhteisiä sairauksia: 2
- MFSD8major facilitator superfamily domain containing 8Yhteisiä sairauksia: 2
- TPP1tripeptidyl peptidase 1Yhteisiä sairauksia: 2
Geeniin PPT1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PPT1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PPT1-geeni: palmitoyl-protein thioesterase 1. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/ppt1
Dante Labs. PPT1-geeni: palmitoyl-protein thioesterase 1 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/ppt1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa