Geen
ADAMTS17
ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17
- HGNC 17109↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000140470↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 170691↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 15q26.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 15: 99 971 437–100 341 975 (GRCh38)
- Eksonid
- 22 eksonit, ulatus 370,5 kb
- Valk
- 1095 aminohapet
- Tuntud ka kui
- FLJ32769, FLJ16363
- MANE Select transkript
- ENST00000268070.9NM_139057.4
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/adamts17.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe ADAMTS17 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni ADAMTS17 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.
Kuidas ADAMTS17 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 6,3 kb kogupikkusega 370,5 kb; neist 3288 alust kodeerivad valku.
ADAMTS17 sekveneerimine
12
positsioonid geenis ADAMTS17, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei jää piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti tabavad.
Terve genoom katab kogu geeni ADAMTS17 370,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksonite 6,3 kb.
ClinVar pathogenic variants (13)
The ADAMTS17 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeenne 3
- Tõenäoliselt patogeenne 10
| Variant | Conditions | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.1721+1G>A (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.662_665del (p.Glu221fs) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.652del (p.Asp218fs) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.2560C>T (p.Arg854Ter) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.1716delC (p.Pro575fs) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.1630G>T (p.Gly544Ter) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.1576-1G>T (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.1475delinsTT (p.His492fs) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.1297C>T (p.Arg433Ter) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.1239G>C (p.Met413Ile) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.1218C>A (p.Cys406Ter) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.681del (p.Leu228fs) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_139057.4(ADAMTS17):c.197_206del (p.Arg66fs) (opens in a new tab) | Weill-Marchesani 4 syndrome, recessive | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
Geeniga ADAMTS17 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida ADAMTS17 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the eye
- Severe near sightedness
- Glaucoma
- Microspherophakia
- Shallow anterior chamber
- Ectopia lentis
- High eye pressure
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Clouding of the lens of the eye
Näita veel 3 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljalase 2026.10.18-8b139e39.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). ADAMTS17 geen: ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/adamts17
Dante Labs. ADAMTS17 geen: ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/adamts17
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast