Gen
DNAAF4
dynein axonemal assembly factor 4
- HGNC 21493↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000256061↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 161582↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 15q21.3
- Coordenadas
- Cromosoma 15: 55.430.308–55.508.234 (GRCh38)
- Exones
- 10 exones en 77,9 kb
- Proteína
- 420 aminoácidos
- También conocido como
- EKN1, FLJ37882, CILD25, pf23
- Símbolos anteriores
- DYX1C1
- Transcrito MANE Select
- ENST00000321149.7NM_130810.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
Esta página como datos
Añada .json a la dirección de la página, o solicite application/json, para leerla como JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dnaaf4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameAnalice DNAAF4 y el resto de su genoma con una sola prueba.
Desde 449 $Envío gratuito · Resultados en 6–8 semanas
Obtener mi Genome TestInforme revisado relevante para este gen
Discinesia ciliar primaria
- Autosómica recesiva
Un trastorno poco frecuente, genéticamente heterogéneo y de afectación predominantemente respiratoria, que se caracteriza por patología crónica de las vías respiratorias superiores e inferiores. Aproximadamente la mitad de los pacientes con DCP presentan una alteración en la lateralidad de los órganos (situs inversus totalis o situs ambiguus/heterotaxia).
- ClinGen clasifica la asociación como definitiva
- 4 remitentes de GenCC la clasifican como definitiva o fuerte
Estructura de DNAAF4
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 2 kb de los 77,9 kb del gen; 1263 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de DNAAF4
2Fácil
Qué tan difícil es secuenciar DNAAF4 con lecturas cortas, sobre 100
0 · Fácil100 · Difícil
Casi todos los exones de DNAAF4 se encuentran en zonas donde las lecturas cortas se alinean sin problemas.
Lo que suma: la proporción de los exones de DNAAF4 en cada tipo de región difícil
- MapeabilidadTramos donde las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser errónea. Peso 35 %.0 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con un 90 % de identidad o más. Peso 30 %.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas se deslizan y podrían no abarcarlas. Peso 15 %.4,8 %
- Contenido de GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma escasa. Peso 10 %.16 %
- Cobertura de referenciaHuecos en el ensamblaje de referencia cercano, donde no hay secuencia con la que alinear las lecturas. Peso 10 %.0 %
Una puntuación de Dante Labs basada en nuestra propia investigación, construida sobre los mapas de regiones difíciles de secuenciar Genome in a Bottle del NIST.Cómo se puntúaCada barra es la proporción de las bases de los exones de DNAAF4 que están en ese tipo de región difícil. La puntuación las pondera según cuánto encarece cada una una llamada con lecturas cortas: 0 cuando ninguna base está en ninguna, 100 cuando todas las bases están en todas ellas.
17
posiciones en DNAAF4 donde ClinVar clasifica una variante como patogénica o probablemente patogénica
Ninguna de ellas cae en una región que las lecturas cortas encuentran difícil.
Un genoma completo cubre los 77,9 kb de DNAAF4, incluidos los intrones, y no solo los 2 kb de exones.
ClinVar pathogenic variants (19)
The DNAAF4 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogénica 9
- Patogénica/probablemente patogénica 2
- Probablemente patogénica 8
| Variante | Conditions | Clasificación en ClinVar | Estado de revisión |
|---|---|---|---|
| NM_130810.4(DNAAF4):c.784-1037_894-2012del (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.583del (p.Lys194_Ile195insTer) (opens in a new tab) | dyslexia, susceptibility to, 1 and 1 other | Patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.523del (p.Ile175fs) (opens in a new tab) | dyslexia, susceptibility to, 1 and 2 others | Patogénica/probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.390_393del (p.Ser131_Val132insTer) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia and 1 other | Patogénica/probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.988C>T (p.Arg330Trp) (opens in a new tab) | dyslexia, susceptibility to, 1 and 1 other | Probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos |
| NM_001033560.1(DNAAF4):c.523dup (p.Ile175Asnfs) (opens in a new tab) | dyslexia, susceptibility to, 1 and 1 other | Probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos |
| NM_130810.3(DNAAF4):c.1048-149_*1048del (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.1153+1G>A (opens in a new tab) | dyslexia, susceptibility to, 1 | Patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.784_893del (p.Trp262fs) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia 25 | Patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.856G>T (p.Glu286Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.808C>T (p.Arg270Ter) (opens in a new tab) | dyslexia, susceptibility to, 1 and 1 other | Patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.589_593del (p.Tyr197fs) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia 25 | Patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.31C>T (p.Gln11Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia 25 | Patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.1111C>T (p.Arg371Ter) (opens in a new tab) | dyslexia, susceptibility to, 1 | Probablemente patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.583dup (p.Ile195fs) (opens in a new tab) | dyslexia, susceptibility to, 1 and 1 other | Probablemente patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.384_390del (p.Lys127_Tyr128insTer) (opens in a new tab) | dyslexia, susceptibility to, 1 and 1 other | Probablemente patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.168del (p.Pro56_Ile57insTer) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia 25 | Probablemente patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.81C>A (p.Cys27Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia 25 | Probablemente patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
| NM_130810.4(DNAAF4):c.3G>A (p.Met1Ile) (opens in a new tab) | dyslexia, susceptibility to, 1 | Probablemente patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
Genes vinculados a las mismas afecciones
- CCDC39coiled-coil domain 39 molecular ruler complex subunitComparte 1 afección
- CCDC40coiled-coil domain 40 molecular ruler complex subunitComparte 1 afección
- CCNOcyclin OComparte 1 afección
- CENPFcentromere protein FComparte 1 afección
- CFAP20DCCFAP20 domain containingComparte 1 afección
- CFAP221cilia and flagella associated protein 221Comparte 1 afección
- CFAP298cilia and flagella associated protein 298Comparte 1 afección
- CFAP300cilia and flagella associated protein 300Comparte 1 afección
- CFAP54cilia and flagella associated protein 54Comparte 1 afección
- CLXNcalaxinComparte 1 afección
- DAW1dynein assembly factor with WD repeats 1Comparte 1 afección
- DNAAF1dynein axonemal assembly factor 1Comparte 1 afección
Rasgos asociados a DNAAF4
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que DNAAF4 puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-18: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista de hallazgos secundarios del ACMG, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de los datos 2026.10.18-8b139e39.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen DNAAF4: dynein axonemal assembly factor 4. Consultado el 18 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/dnaaf4
Dante Labs. Gen DNAAF4: dynein axonemal assembly factor 4 [Internet]. [citado 18 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/dnaaf4
Una prueba. Respuestas para toda la vida.
Desde 449 $Envío gratuito · Resultados en 6–8 semanas