Γονίδιο
AKR1D1
aldo-keto reductase family 1 member D1
- HGNC 388↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000122787↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 6718↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 7q33
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 7: 138.076.459–138.118.305 (GRCh38)
- Εξόνια
- 9 έξώνια σε 41,8 kb
- Πρωτεΐνη
- 326 αμινοξέα
- Προηγούμενα σύμβολα
- SRD5B1
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000242375.8NM_005989.4
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Share this page
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/akr1d1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το AKR1D1, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένη αναφορά που σχετίζεται με αυτό το γονίδιο
Συγγενής διαταραχή σύνθεσης χολικών οξέων 2
- Αυτοσωμικός υπολειπόμενος
Προκαλείται από μεταβολές και στα δύο αντίγραφα του γονιδίου AKR1D1, το οποίο κωδικοποιεί το ένζυμο δέλτα-4-3-οξοστεροειδές 5-βήτα-αναγωγάση. Χωρίς αυτό το ένζυμο δεν παράγονται φυσιολογικά χολικά οξέα, και συσσωρεύονται παθολογικά χολικά οξέα που βλάπτουν το ήπαρ.
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 4 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
▶Δυνατότητα δράσης
Η perorală χοληνοδεοξυχολικό οξύ από το στόμα αντικαθιστά τα χολικά οξέα που λείπουν. Όταν ξεκινά νωρίς, μπορεί να βελτιώσει τον ίκτερο, τη λειτουργία του ήπατος και το μέγεθός του. Παρακολουθούνται τα επίπεδα των λιποδιαλυτών βιταμινών και η λειτουργία του ήπατος. Συνιστάται γενετική συμβουλευτική, ενώ είναι διαθέσιμος έλεγχος φορέων για συγγενείς.
Πώς είναι διαταγμένο το AKR1D1
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 2,7 kb από τα 41,8 kb του γονιδίου· 981 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχηση του AKR1D1
1Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι να αλληλουχηθεί το AKR1D1 με σύντομα αναγνώσματα, από το 100
0 · Εύκολο100 · Δύσκολο
Σχεδόν όλα τα εξόνια του AKR1D1 βρίσκονται σε σημεία όπου τα σύντομα αναγνώσματα αντιστοιχίζονται καθαρά.
Τι προσθέτει: το ποσοστό των εξονίων του AKR1D1 σε κάθε είδος δύσκολης περιοχής
- ΧαρτογραφησιμότηταΤμήματα όπου αναγνώσματα των 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι λανθασμένη. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 100.0%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παραλόγοι και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή μεγαλύτερη. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 60.0%
- Κοινό με το chrYΟι ψευδοαυτοσωμικές περιοχές και η περιοχή X-transposed, όπου τα chrX και chrY φέρουν την ίδια ή σχεδόν την ίδια αλληλουχία, οπότε ένα ανάγνωσμα από το ένα μπορεί να τοποθετηθεί στο άλλο. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 60.0%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στο κοντινό σύνθετο γονιδίωμα αναφοράς, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία τα αναγνώσματα μπορούν να ευθυγραμμιστούν. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 50.0%
- ΕπαναλήψειςTandem επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες τα αναγνώσματα ολισθαίνουν και ενδέχεται να μην τις καλύπτουν πλήρως. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 30.4,4%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει αραιά. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 20.0%
Βαθμολογία της Dante Labs από δική μας έρευνα, βασισμένη στους χάρτες δύσκολα αλληλουχούμενων περιοχών Genome in a Bottle του NIST.Πώς βαθμολογείταιΚάθε ράβδος είναι το ποσοστό των βάσεων των εξονίων του AKR1D1 σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Κάθε είδος μπορεί από μόνο του να κάνει ένα γονίδιο δύσκολο, και καθένα επιπλέον προσθέτει λιγότερο: 0 όταν καμία βάση δεν βρίσκεται σε κάποια, 100 όταν κάθε βάση βρίσκεται εκεί όπου τα αναγνώσματα δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά.
19
θέσεις στο AKR1D1 όπου το ClinVar κατατάσσει μια αλλαγή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που τα σύντομα αναγνώσματα δυσκολεύονται να καλύψουν.
Ένα πλήρες γονιδίωμα καλύπτει και τα 41,8 kb του AKR1D1, συμπεριλαμβανομένων των intronic περιοχών, και όχι μόνο τα 2,7 kb των εξονίων.
Παθογόνες παραλλαγές ClinVar (19)
Οι παραλλαγές του AKR1D1 που το ClinVar κατατάσσει ως παθογόνες ή πιθανώς παθογόνες για οποιαδήποτε πάθηση, έχουν αξιολογηθεί από τουλάχιστον έναν υποβάλλοντα με κριτήρια, καθώς και οι πιο αξιολογημένες από αυτές. Είναι η δημόσια καταγραφή του ClinVar για το γονίδιο και σε καμία περίπτωση αποτέλεσμα.
- Παθογόνο 5
- Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο 3
- Πιθανώς παθογόνο 11
| Παραλλαγή | Παθήσεις | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|
| NM_005989.4(AKR1D1):c.148C>T (p.Arg50Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.796C>T (p.Arg266Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.797G>A (p.Arg266Gln) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.398C>G (p.Pro133Arg) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.593C>T (p.Pro198Leu) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.864del (p.Ser290fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.238del (p.Glu80fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.267G>A (p.Trp89Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.580-13T>A (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.614del (p.Leu205fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.781C>T (p.Arg261Cys) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect και 1 ακόμη | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.141_142del (p.Gly48fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.158A>G (p.Asp53Gly) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.174_175del (p.Tyr58_Gln59delinsTer) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.261+2T>C (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.332T>C (p.Leu111Pro) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.583G>T (p.Glu195Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.919C>T (p.Arg307Cys) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_005989.4(AKR1D1):c.940T>C (p.Trp314Arg) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | congenital bile acid synthesis defect 2 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το AKR1D1
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το AKR1D1. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Abnormality of the digestive system
- Giant cell hepatitis
- Enlarged liver
- Fat in feces
- Fat malabsorption
- Jaundice
- Liver failure
- Prolonged yellowing of skin in newborn
- Slowed or blocked flow of bile from liver
Εμφάνιση 3 ακόμη χαρακτηριστικών
Laboratory abnormality
- Abnormal circulating enzyme concentration or activity
- High blood bilirubin levels
- Abnormal serum bile acid concentration
- Conjugated hyperbilirubinemia
- Dark urine
- Elevated alkaline phosphatase
- Fatty infiltration of liver
- High liver enzymes
Εμφάνιση 2 ακόμη χαρακτηριστικών
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-19: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.19-9814e911.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο AKR1D1: aldo-keto reductase family 1 member D1. Ανάκτηση 21 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/akr1d1
Dante Labs. Γονίδιο AKR1D1: aldo-keto reductase family 1 member D1 [Internet]. [ανακτήθηκε 21 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/akr1d1
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες