Gen
PRORP
protein only RNase P catalytic subunit
- HGNC 19958↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000100890↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 9692↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 14q13.2
- Koordinater
- Kromosom 14: 35.122.552–35.277.622 (GRCh38)
- Exoner
- 8 exoner fordelt over 155,1 kb
- Protein
- 583 aminosyrer
- Også kendt som
- MRPP3
- Tidligere symboler
- KIAA0391
- MANE Select-transkript
- ENST00000534898.9NM_014672.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/prorp.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs PRORP og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Primær mitokondriel sygdom
- Kombineret oxidativ fosforyleringsmangel
Sygdomme, som oftest skyldes kernegener involveret i produktionen af mitokondrielle proteiner. De reducerer flere respirationskædekomplekser samtidigt og giver ofte alvorlig sygdom i flere organsystemer i barndommen.
- 1 GenCC-indsender vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Viden kan afslutte en diagnostisk søgen og vejlede overvågning og understøttende behandling.
Sådan er PRORP opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 6,2 kb af genets 155,1 kb; 1.752 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af PRORP
1Lav
Hvor svært PRORP er at sekventere med korte læsninger, på en skala fra 0 til 100Hver søjle viser andelen af PRORPs exonbaser i den pågældende type vanskeligt område. Scoren vægter dem efter, hvor meget hver enkelt koster et kald baseret på korte læsninger: 0, når ingen base ligger i nogen, og 100, når hver base ligger i alle af dem.
- MappabilitetStrækninger, hvor læsninger på 100 eller 250 bp ikke kan placeres entydigt, så et kald dér kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandemgentagelser og serier af én base, som læsninger glider på, og som muligvis ikke kan spændes over. Vægt 15 %.3,2 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker dårligt. Vægt 10 %.0,8 %
- ReferencedækningHuller i referencesamlingen i nærheden, hvor der ikke findes nogen sekvens, som læsningerne kan justeres mod. Vægt 10 %.0 %
2
positioner i PRORP, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i et område, som korte læsninger har svært ved at læse.
En helgenomsekventering dækker alle 155,1 kb af PRORP, inklusive introner, ikke kun de 6,2 kb af exoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeler 1 sygdom
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Deler 1 sygdom
- ATP5F1AATP synthase F1 subunit alphaDeler 1 sygdom
- ATP5F1DATP synthase F1 subunit deltaDeler 1 sygdom
- ATP5F1EATP synthase F1 subunit epsilonDeler 1 sygdom
- ATP5POATP synthase peripheral stalk subunit OSCPDeler 1 sygdom
- C1QBPcomplement C1q binding proteinDeler 1 sygdom
- C2orf69chromosome 2 open reading frame 69Deler 1 sygdom
- CARS2cysteinyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeler 1 sygdom
- CRLS1cardiolipin synthase 1Deler 1 sygdom
- EARS2glutamyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeler 1 sygdom
- ELAC2elaC ribonuclease Z 2Deler 1 sygdom
Træk knyttet til PRORP
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, PRORP kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-17: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). PRORP-genet: protein only RNase P catalytic subunit. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/prorp
Dante Labs. PRORP-genet: protein only RNase P catalytic subunit [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/prorp
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger