Gen
SMPX
small muscle protein X-linked
- HGNC 11122↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000091482↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 23676↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- Xp22.12
- Souřadnice
- Chromozom X: 21 705 978–21 758 116 (GRCh38)
- Exony
- 5 exonů na 52,1 kb
- Protein
- 88 aminokyselin
- Další názvy
- DFNX4, Chisel, Csl
- Předchozí symboly
- DFN6
- Transkript MANE Select
- ENST00000379494.4NM_014332.3
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SMPX i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Distal Myopathies
- Distal myopathy
A group of inherited muscle disorders in which weakness starts in the hands, forearms, lower legs or feet, caused by genes such as TTN, DYSF, FLNC, MYH7, ADSS1, SMPX and MATR3.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Hearing Loss and Deafness
- Nonsyndromic Genetic Hearing Loss
Jeden z 97 genů spojených s touto vazbou
Inherited hearing loss without other medical features, including the common recessive forms caused by GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC and many other genes, as well as dominant, X-linked and mitochondrial forms.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing the genetic cause can guide hearing support and cochlear implant decisions, gene-therapy trial eligibility (for example OTOF) and family counselling.
Jak je SMPX uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 0,9 kb z 52,1 kb genu; 267 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SMPX
6
pozic v genu SMPX, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 52,1 kb genu SMPX, včetně intronů, nikoli jen 0,9 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ACTG1actin gamma 1Sdílí 1 onemocnění
- ADSS1adenylosuccinate synthase 1Sdílí 1 onemocnění
- AFG2BAAA ATPase AFG2BSdílí 1 onemocnění
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Sdílí 1 onemocnění
- ANO5anoctamin 5Sdílí 1 onemocnění
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ASdílí 1 onemocnění
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Sdílí 1 onemocnění
- CABP2calcium binding protein 2Sdílí 1 onemocnění
- CD164CD164 moleculeSdílí 1 onemocnění
- CDC14Acell division cycle 14ASdílí 1 onemocnění
- CDH23cadherin related 23Sdílí 1 onemocnění
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s SMPX
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SMPX. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SMPX: small muscle protein X-linked. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/smpx
Dante Labs. Gen SMPX: small muscle protein X-linked [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/smpx
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů