Gen
GPIHBP1
glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 1
- HGNC 24945↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000277494↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 338328↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 8q24.3
- Koordinater
- Kromosom 8: 143 213 218–143 217 170 (GRCh38)
- Exoner
- 4 exoner på 4 kb
- Protein
- 184 aminosyror
- Även känd som
- LOC338328, GPI-HBP1
- MANE Select-transkript
- ENST00000622500.2NM_178172.6
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gpihbp1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs GPIHBP1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Hyperlipidemi
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är GPIHBP1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,3 kb av genens 4 kb, och 555 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av GPIHBP1
6Låg
Hur svår GPIHBP1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av GPIHBP1s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.7 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.50 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
13
positioner i GPIHBP1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 4 kb av GPIHBP1, inklusive introner, inte bara de 2,3 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- APOA5apolipoprotein A5Delar 1 tillstånd
- APOBapolipoprotein BDelar 1 tillstånd
- APOC2apolipoprotein C2Delar 1 tillstånd
- APOEapolipoprotein EDelar 1 tillstånd
- CETPcholesteryl ester transfer proteinDelar 1 tillstånd
- LDLRlow density lipoprotein receptorDelar 1 tillstånd
- LDLRAP1low density lipoprotein receptor adaptor protein 1Delar 1 tillstånd
- LIPClipase C, hepatic typeDelar 1 tillstånd
- LPLlipoprotein lipaseDelar 1 tillstånd
- PCSK9proprotein convertase subtilisin/kexin type 9Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till GPIHBP1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som GPIHBP1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). GPIHBP1-genen: glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/gpihbp1
Dante Labs. GPIHBP1-genen: glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/gpihbp1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor