Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

CLCNKA

chloride voltage-gated channel Ka

Sammanfattning

Cytogenetisk position
1p36.13
Koordinater
Kromosom 1: 16 022 036–16 034 050 (GRCh38)
Exoner
20 exoner på 12 kb
Protein
687 aminosyror
Även känd som
hClC-Ka, ClC-K1, CLCK1
MANE Select-transkript
ENST00000331433.5NM_004070.4
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser CLCNKA ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är CLCNKA uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 1, med en parentes där CLCNKA finns. CLCNKA och 22 gener i närheten på kromosom 1, från 15 528 043 till 16 528 042.Kromosom 11p36.13p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4415,6 Mb15,8 Mb16 Mb16,2 Mb16,4 MbDNAJC16: 15 526 813–15 592 379, framåt-strängDNAJC16AGMAT: 15 571 699–15 585 084, bakåt-strängAGMATDDI2: 15 617 416–15 669 044, framåt-strängDDI2RSC1A1: 15 659 713–15 662 033, framåt-strängRSC1A1PLEKHM2: 15 681 461–15 734 771, framåt-strängPLEKHM2SLC25A34: 15 736 176–15 741 392, framåt-strängSLC25A34TMEM82: 15 742 488–15 747 982, framåt-strängTMEM82FBLIM1: 15 756 604–15 786 594, framåt-strängFBLIM1UQCRHL: 15 807 169–15 809 348, bakåt-strängUQCRHLSPEN: 15 836 095–15 940 456, framåt-strängSPENZBTB17: 15 940 148–15 976 132, bakåt-strängZBTB17SRARP: 16 004 229–16 009 382, framåt-strängSRARPHSPB7: 16 014 018–16 020 597, bakåt-strängHSPB7CLCNKA: 16 022 036–16 034 050, framåt-strängCLCNKACLCNKB: 16 040 252–16 057 367, framåt-strängCLCNKBFAM131C: 16 057 769–16 073 664, bakåt-strängEPHA2: 16 124 337–16 156 141, bakåt-strängEPHA2ARHGEF19: 16 197 854–16 212 893, bakåt-strängARHGEF19CPLANE2: 16 231 692–16 237 214, bakåt-strängCPLANE2FBXO42: 16 246 840–16 352 494, bakåt-strängFBXO42SZRD1: 16 352 575–16 398 147, framåt-strängSZRD1SPATA21: 16 387 117–16 437 424, bakåt-strängSPATA21NECAP2: 16 440 664–16 460 092, framåt-strängNECAP2Diagram över CLCNKA: 20 exoner på framåt-strängen av kromosom 1Exon 2: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 16: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 17: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 18: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 1: 16 022 036–16 022 063, 28 baserExon 2: 16 022 613–16 022 719, 107 baserExon 3: 16 023 800–16 023 928, 129 baserExon 4: 16 024 763–16 024 891, 129 baserExon 5: 16 026 108–16 026 247, 140 baserExon 6: 16 026 536–16 026 613, 78 baserExon 7: 16 026 697–16 026 775, 79 baserExon 8: 16 027 310–16 027 435, 126 baserExon 9: 16 027 821–16 027 905, 85 baserExon 10: 16 028 018–16 028 119, 102 baserExon 11: 16 028 761–16 028 845, 85 baserExon 12: 16 029 126–16 029 299, 174 baserExon 13: 16 029 731–16 029 800, 70 baserExon 14: 16 029 965–16 030 075, 111 baserExon 15: 16 030 461–16 030 674, 214 baserExon 16: 16 031 710–16 031 843, 134 baserExon 17: 16 032 203–16 032 291, 89 baserExon 18: 16 032 443–16 032 526, 84 baserExon 19: 16 033 170–16 033 256, 87 baserExon 20: 16 033 611–16 034 050, 440 baser124681012141618205′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 2,5 kb av genens 12 kb, och 2 064 av dessa baser kodar för proteinet.

Så läser ett genomtest CLCNKA

4

positioner i CLCNKA där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

4 av dem (100 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.

  • Segmental duplications (4 ställen)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

En helgenomsanalys täcker alla 12 kb av CLCNKA, med introner inräknade, inte bara de 2,5 kb exoner.

Egenskaper kopplade till CLCNKA

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som CLCNKA kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). CLCNKA-genen: chloride voltage-gated channel Ka. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/clcnka

Vancouver

Dante Labs. CLCNKA-genen: chloride voltage-gated channel Ka [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/clcnka

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test