Gene
SUPT7L
SPT7 like, STAGA complex subunit gamma
- HGNC 30632↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000119760↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 9913↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 2p23.3
- Coordenadas
- Cromossoma 2: 27 650 809–27 663 614 (GRCh38)
- Exões
- 6 exões ao longo de 12,8 kb
- Proteína
- 414 aminoácidos
- Também conhecido como
- STAF65gamma, KIAA0764, SPT7L, STAF65
- Transcrito MANE Select
- ENST00000337768.10NM_014860.3
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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page$gene$nameAnalise SUPT7L, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Nenhum relatório do Genome Test analisa SUPT7L ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.
Como SUPT7L está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 4,3 kb dos 12,8 kb do gene; 1245 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de SUPT7L
0Fácil
Dificuldade de sequenciação de SUPT7L com leituras curtas, em 100
0 · Fácil100 · Difícil
Quase todos os exões de SUPT7L se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.
O que acresce: a proporção dos exões de SUPT7L em cada tipo de região difícil
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessa zona pode estar em falta ou ser incorreta. Peso 100%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutros pontos do genoma, como parálogos e pseudogenes, com identidade de 90% ou mais. Peso 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Peso 60%.0%
- Cobertura da referênciaLacunas nas proximidades na montagem de referência, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Peso 50%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não as abranger. Peso 30%.1%
- Conteúdo GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma insuficiente. Peso 20%.0%
Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de SUPT7L nesse tipo de região difícil. Qualquer tipo pode, por si só, tornar um gene difícil, e cada tipo adicional acrescenta menos: 0 quando nenhuma base está em nenhum, 100 quando todas as bases estão em regiões onde as leituras não podem ser posicionadas de forma única.
Características associadas a SUPT7L
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que SUPT7L pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene SUPT7L: SPT7 like, STAGA complex subunit gamma. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/supt7l
Dante Labs. Gene SUPT7L: SPT7 like, STAGA complex subunit gamma [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/supt7l
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