Gen
RAC2
Rac family small GTPase 2
- HGNC 9802↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000128340↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 5880↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 22q13.1
- Coördinaten
- Chromosoom 22: 37.225.270–37.244.269 (GRCh38)
- Exons
- 7 exons over 19 kb
- Eiwit
- 192 aminozuren
- Ook bekend als
- EN-7
- MANE Select-transcript
- ENST00000249071.11NM_002872.5
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rac2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees RAC2 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Ernstige gecombineerde immuundeficiëntie
- Autosomaal recessief
Ernstige gecombineerde immuundeficiëntie (SCID) omvat een groep zeldzame monogene primaire immuundeficiëntieziekten die worden gekenmerkt door een gebrek aan functionele perifere T-lymfocyten, wat leidt tot ernstige luchtweginfecties die al vroeg in het leven optreden en tot een achterblijvende groei. Ze worden naar immunologisch fenotype ingedeeld in SCID met afwezigheid van T-cellen maar aanwezigheid van B-cellen (T-B+ SCID) of SCID met afwezigheid van beide (T-B- SCID). Beide groepen omvatten verschillende vormen, met of zonder natural killer (NK)-cellen.
- ClinGen beoordeelt het verband als sterk
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Bredere groeperingen
Overige aangeboren immuunstoornissen
- Immuundeficiëntieziekte
Een van 170 genen die hiermee verband houden
Ziekte waarbij er een tekort of defect is in de mechanismen van de immuniteit, zowel cellulair als humoraal.
- ClinGen beoordeelt het verband als sterk
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
HSCT bij SCID en ernstige PID's; immunoglobulinevervangende therapie (IVIG/SCIG) bij antilichaamdeficiënties; leniolisib (Joenja, FDA 2023) bij APDS; genetherapie bij ADA-SCID; abatacept bij CTLA4- of LRBA-deficiëntie; profylactische antibiotica; G-CSF bij CGD
Opbouw van RAC2
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,5 kb van de 19 kb van het gen; 579 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van RAC2
1Laag
Hoe moeilijk RAC2 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100Elke balk is het aandeel van de exonbasen van RAC2 in dat type moeilijke regio. De score weegt deze naar hoeveel elk een short-read-call kost: 0 wanneer geen enkele base in een van deze regio's valt, 100 wanneer elke base in alle regio's valt.
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek geplaatst kunnen worden, waardoor een call daar kan ontbreken of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen schuiven en die ze mogelijk niet overbruggen. Gewicht 15%.0%
- GC-gehalteVensters onder 25% of boven 65% G en C, die de bibliotheekvoorbereiding slechts dun dekt. Gewicht 10%.9%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentieassemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Gewicht 10%.0%
4
posities in RAC2 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen ervan valt in een gebied dat korte reads lastig vinden.
Een volledig genoom dekt alle 19 kb van RAC2, inclusief intronen, en niet alleen de 1,5 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ADAadenosine deaminaseDeelt 2 aandoeningen
- AK2adenylate kinase 2Deelt 2 aandoeningen
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeelt 2 aandoeningen
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Deelt 2 aandoeningen
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Deelt 2 aandoeningen
- CD247CD247 moleculeDeelt 2 aandoeningen
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexDeelt 2 aandoeningen
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexDeelt 2 aandoeningen
- CD70CD70 moleculeDeelt 2 aandoeningen
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorDeelt 2 aandoeningen
- CORO1Acoronin 1ADeelt 2 aandoeningen
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CDeelt 2 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan RAC2
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die RAC2 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-17: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.18-e609d43e.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). RAC2-gen: Rac family small GTPase 2. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/rac2
Dante Labs. RAC2-gen: Rac family small GTPase 2 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/rac2
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken