Gen
ATP13A3
ATPase 13A3
- HGNC 24113↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000133657↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 79572↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 3q29
- Coördinaten
- Chromosoom 3: 194.402.677–194.487.002 (GRCh38)
- Exons
- 34 exons over 84,3 kb
- Eiwit
- 1.256 aminozuren
- Ook bekend als
- AFURS1
- MANE Select-transcript
- ENST00000645319.2NM_001367549.1
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atp13a3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees ATP13A3 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Erfelijke pulmonale arteriële hypertensie (HPAH)
- Erfelijke pulmonale arteriële hypertensie
Erfelijke pulmonale arteriële hypertensie (HPAH) is een vorm van pulmonale arteriële hypertensie (PAH) die ontstaat door mutaties in genen die PAH veroorzaken, of in een familiale context. HPAH wordt gekenmerkt door een verhoogde weerstand in de longslagaders, wat kan leiden tot rechterhartenfalen. HPAH verloopt progressief en kan fataal zijn.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Opbouw van ATP13A3
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 7,5 kb van de 84,3 kb van het gen; 3.771 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van ATP13A3
2Laag
Hoe moeilijk ATP13A3 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100Elke balk is het aandeel van de exonbasen van ATP13A3 in dat type moeilijke regio. De score weegt deze naar hoeveel elk een short-read-call kost: 0 wanneer geen enkele base in een van deze regio's valt, 100 wanneer elke base in alle regio's valt.
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek geplaatst kunnen worden, waardoor een call daar kan ontbreken of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen schuiven en die ze mogelijk niet overbruggen. Gewicht 15%.4,9%
- GC-gehalteVensters onder 25% of boven 65% G en C, die de bibliotheekvoorbereiding slechts dun dekt. Gewicht 10%.17%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentieassemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Gewicht 10%.0%
5
posities in ATP13A3 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen ervan valt in een gebied dat korte reads lastig vinden.
Een volledig genoom dekt alle 84,3 kb van ATP13A3, inclusief intronen, en niet alleen de 7,5 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-17: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). ATP13A3-gen: ATPase 13A3. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/atp13a3
Dante Labs. ATP13A3-gen: ATPase 13A3 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/atp13a3
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken