Gén
TENT5A
terminal nucleotidyltransferase 5A
- HGNC 18345↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000112773↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 55603↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 6q14.1
- Koordináták
- 6. kromoszóma: 81 745 730–81 752 681 (GRCh38)
- Exonok
- 3 exon, összesen 7 kb
- Fehérje
- 442 aminosav
- Más néven ismert
- FLJ20037
- Korábbi jelölések
- C6orf37, FAM46A
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000320172.11NM_017633.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tent5a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a TENT5A-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Osteogenesis Imperfecta
A group of inherited connective tissue disorders causing fragile bones that break easily, often with blue sclerae, hearing loss and dental problems.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Cyclic IV bisphosphonates (pamidronate, zoledronate); orthopedic rodding of long bones; physical therapy; denosumab (in clinical use for pediatric OI); romosozumab (in development); hearing monitoring; dental management for dentinogenesis imperfecta
A TENT5A felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 7 kb-jából 5,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1329 bázis kódolja a fehérjét.
TENT5A szekvenálása
5Könnyű
Mennyire nehéz a TENT5A szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A TENT5A exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ami tovább nehezíti: a TENT5A exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 100%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Súly: 60%.0%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 50%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 30%.9,7%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 20%.10%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a TENT5A exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ANO5anoctamin 51 betegséget oszt meg
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a21 betegséget oszt meg
- BMP1bone morphogenetic protein 11 betegséget oszt meg
- COL1A1collagen type I alpha 1 chain1 betegséget oszt meg
- COL1A2collagen type I alpha 2 chain1 betegséget oszt meg
- CREB3L1cAMP responsive element binding protein 3 like 11 betegséget oszt meg
- CRTAPcartilage associated protein1 betegséget oszt meg
- FKBP10FKBP prolyl isomerase 101 betegséget oszt meg
- GORABgolgin, RAB6 interacting1 betegséget oszt meg
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 11 betegséget oszt meg
- IFITM5interferon induced transmembrane protein 51 betegséget oszt meg
- KDELR2KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 21 betegséget oszt meg
A(z) TENT5A génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) TENT5A gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). TENT5A gén: terminal nucleotidyltransferase 5A. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/tent5a
Dante Labs. TENT5A gén: terminal nucleotidyltransferase 5A [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/tent5a
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt