Gén
HYAL1
hyaluronidase 1
- HGNC 5320↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000114378↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 3373↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 3p21.31
- Koordináták
- 3. kromoszóma: 50 299 893–50 303 574 (GRCh38)
- Exonok
- 4 exon, összesen 3,7 kb
- Fehérje
- 435 aminosav
- Más néven ismert
- LUCA1, HYAL-1
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000395144.7NM_033159.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Share this page
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hyal1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a HYAL1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Lysosomal Storage Disease
- Lysosomal storage disease (other and unspecified types)
A 59 hozzá kapcsolódó gén egyike
Covers lysosomal storage diseases without a dedicated report, such as Farber disease and other ASAH1-related disorders, prosaposin (PSAP) deficiencies, multiple sulfatase deficiency, mucopolysaccharidosis types IX and X, and Dorfman-Chanarin disease; inheritance varies by subtype, most often autosomal recessive.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: mérsékelt
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A HYAL1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 3,7 kb-jából 2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1308 bázis kódolja a fehérjét.
HYAL1 szekvenálása
5Könnyű
Mennyire nehéz a HYAL1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A HYAL1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ehhez hozzájárul: a HYAL1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.0%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.25%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a HYAL1 exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
50
a HYAL1 azon pozíciói, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül egy sem olyan régióban van, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genom a HYAL1 mind a 3,7 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 2 kb exont.
ClinVar patogén variánsok (53)
A ClinVar által patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősített HYAL1-variánsok bármely betegséggel kapcsolatban, legalább egy, kritériumokat alkalmazó beküldő által felülvizsgálva, valamint ezek közül a legtöbbet felülvizsgált változatok. Ez a gén nyilvános ClinVar-nyilvántartása, nem pedig eredmény.
- Patogén 26
- Patogén/valószínűleg patogén 12
- Valószínűleg patogén 15
| Variáns | Betegségek | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_033159.4(HYAL1):c.104del (p.Val35fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.872_873del (p.Phe290_Tyr291insTer) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.663_670dup (p.Gly224fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.586_598del (p.Arg196fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.546G>A (p.Trp182Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.445C>T (p.Gln149Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.390G>A (p.Trp130Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.238_239del (p.Gly80fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.221dup (p.Tyr75fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.221del (p.Phe74fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.201del (p.Gly68fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.110_134dup (p.Arg46fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.81del (p.Asn29fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.900+1G>A (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.674_676delinsCTGTGCCCAAAATGTGCCCATCAGGTCATCA (p.Ile225fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_033159.4(HYAL1):c.937C>T (p.Gln313Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_033159.4(HYAL1):c.787C>T (p.Gln263Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_033159.4(HYAL1):c.775C>T (p.Gln259Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_033159.4(HYAL1):c.773C>G (p.Ser258Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_033159.4(HYAL1):c.707G>A (p.Trp236Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_033159.4(HYAL1):c.691del (p.Gln231fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_033159.4(HYAL1):c.658C>T (p.Gln220Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_033159.4(HYAL1):c.621C>A (p.Cys207Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_033159.4(HYAL1):c.599del (p.Gly200fs) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_033159.4(HYAL1):c.597G>A (p.Trp199Ter) (új lapon nyílik meg) | mucopolysaccharidosis type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Mind a 53 megtekintése a ClinVar összes többi HYAL1-variánsával együtt → (új lapon nyílik meg)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferase1 betegséget oszt meg
- AGAaspartylglucosaminidase1 betegséget oszt meg
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 11 betegséget oszt meg
- ARSAarylsulfatase A1 betegséget oszt meg
- ARSBarylsulfatase B1 betegséget oszt meg
- ARSKarylsulfatase family member K1 betegséget oszt meg
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 11 betegséget oszt meg
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 61 betegséget oszt meg
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, battenin1 betegséget oszt meg
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthase1 betegséget oszt meg
- CLN6CLN6 transmembrane ER protein1 betegséget oszt meg
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC protein1 betegséget oszt meg
A(z) HYAL1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) HYAL1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). HYAL1 gén: hyaluronidase 1. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/hyal1
Dante Labs. HYAL1 gén: hyaluronidase 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/hyal1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt