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Gène

TAPT1

transmembrane anterior posterior transformation 1

Résumé

Localisation cytogénétique
4p15.32
Coordonnées
Chromosome 4 : 16 160 505–16 226 471 (GRCh38)
Exons
14 exons sur 66 kb
Protéine
567 acides aminés
Aussi appelé
FLJ90013
Transcrit MANE Select
ENST00000405303.7NM_153365.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TAPT1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TAPT1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 4, avec un crochet à l'emplacement de TAPT1. TAPT1 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 4, de 15 693 488 à 16 693 487.Chromosome 44p15.32p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.215,8 Mb16 Mb16,2 Mb16,4 Mb16,6 MbBST1 : 15 702 993–15 775 614, brin directBST1CD38 : 15 778 275–15 853 232, brin directCD38FGFBP1 : 15 934 507–15 948 427, brin inverseFGFBP1FGFBP2 : 15 960 245–15 969 309, brin inverseFGFBP2PROM1 : 15 963 076–16 084 378, brin inversePROM1TAPT1 : 16 160 505–16 226 471, brin inverseTAPT1LDB2 : 16 501 534–16 898 961, brin inverseLDB2Schéma de TAPT1 : 14 exons sur le brin inverse du chromosome 4Exon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 2 : 1 site connu associé à une maladieExon 14 : 16 160 505–16 163 537, 3 033 basesExon 13 : 16 166 633–16 166 793, 161 basesExon 12 : 16 170 653–16 170 729, 77 basesExon 11 : 16 174 204–16 174 272, 69 basesExon 10 : 16 174 670–16 174 729, 60 basesExon 9 : 16 176 119–16 176 228, 110 basesExon 8 : 16 179 577–16 179 657, 81 basesExon 7 : 16 186 535–16 186 604, 70 basesExon 6 : 16 186 781–16 186 878, 98 basesExon 5 : 16 188 220–16 188 355, 136 basesExon 4 : 16 191 361–16 191 523, 163 basesExon 3 : 16 202 462–16 202 580, 119 basesExon 2 : 16 213 768–16 213 898, 131 basesExon 1 : 16 226 259–16 226 471, 213 bases141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,5 kb sur les 66 kb du gène ; 1 704 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit TAPT1

3

positions dans TAPT1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 66 kb de TAPT1, introns compris, et pas seulement les 4,5 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TAPT1 : transmembrane anterior posterior transformation 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tapt1

Vancouver

Dante Labs. Gène TAPT1 : transmembrane anterior posterior transformation 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tapt1

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