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Gène

SEMA3F

semaphorin 3F

Résumé

Localisation cytogénétique
3p21.31
Coordonnées
Chromosome 3 : 50 155 324–50 189 075 (GRCh38)
Exons
19 exons sur 33,8 kb
Protéine
785 acides aminés
Aussi appelé
SEMAK, Sema4
Transcrit MANE Select
ENST00000002829.8NM_004186.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

  • Hypogonadisme hypogonadotrope

    • Fonctionnement ovarien ou testiculaire anormal dû à une stimulation hormonale insuffisante issue de l'axe hypothalamo-hypophysaire.

      • 1 soumetteur GenCC le classe comme définitif ou fort

Structure de SEMA3F

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de SEMA3F. SEMA3F et 37 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 49 672 200 à 50 672 199.Chromosome 33p21.31p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2949,8 Mb50 Mb50,2 Mb50,4 Mb50,6 MbAPEH : 49 673 818–49 683 973, brin directMST1 : 49 683 922–49 689 501, brin inverseMST1RNF123 : 49 688 740–49 723 389, brin directRNF123AMIGO3 : 49 716 829–49 719 684, brin inverseAMIGO3GMPPB : 49 716 844–49 723 988, brin inverseGMPPBIP6K1 : 49 724 294–49 786 557, brin inverseIP6K1CDHR4 : 49 790 732–49 799 879, brin inverseCDHR4INKA1 : 49 803 228–49 805 237, brin directINKA1UBA7 : 49 805 205–49 814 151, brin inverseUBA7TRAIP : 49 828 595–49 856 597, brin inverseTRAIPCAMKV : 49 857 214–49 870 064, brin inverseCAMKVMST1R : 49 886 902–49 906 130, brin inverseMST1RMON1A : 49 907 160–49 930 173, brin inverseMON1ARBM6 : 49 940 007–50 100 045, brin directRBM6RBM5 : 50 088 898–50 119 021, brin directRBM5SEMA3F : 50 155 324–50 189 075, brin directSEMA3FGNAT1 : 50 191 586–50 197 696, brin directGNAT1SLC38A3 : 50 202 871–50 221 504, brin directSLC38A3GNAI2 : 50 226 292–50 259 362, brin directGNAI2SEMA3B : 50 267 507–50 277 573, brin directSEMA3BLSMEM2 : 50 279 030–50 288 116, brin directLSMEM2IFRD2 : 50 286 003–50 292 918, brin inverseIFRD2HYAL3 : 50 292 830–50 299 437, brin inverseHYAL3NAA80 : 50 296 402–50 299 437, brin inverseHYAL1 : 50 299 883–50 312 890, brin inverseHYAL2 : 50 313 396–50 324 687, brin inverseTUSC2 : 50 320 027–50 328 251, brin inverseRASSF1 : 50 329 782–50 340 980, brin inverseZMYND10 : 50 341 110–50 345 746, brin inverseNPRL2 : 50 347 330–50 350 826, brin inverseNPRL2CYB561D2 : 50 350 834–50 358 460, brin directCYB561D2 : 50 350 892–50 367 923, brin directTMEM115 : 50 352 820–50 359 566, brin inverseCACNA2D2 : 50 362 613–50 504 244, brin inverseC3orf18 : 50 556 409–50 573 568, brin inverseC3orf18HEMK1 : 50 567 895–50 596 168, brin directHEMK1CISH : 50 606 456–50 611 984, brin inverseCISHMAPKAPK3 : 50 611 487–50 651 017, brin directMAPKAPK3Schéma de SEMA3F : 19 exons sur le brin direct du chromosome 3Exon 1 : 50 155 324–50 155 564, 241 basesExon 2 : 50 159 575–50 159 734, 160 basesExon 3 : 50 173 793–50 173 953, 161 basesExon 4 : 50 174 052–50 174 114, 63 basesExon 5 : 50 174 231–50 174 350, 120 basesExon 6 : 50 175 096–50 175 188, 93 basesExon 7 : 50 176 768–50 176 861, 94 basesExon 8 : 50 182 284–50 182 403, 120 basesExon 9 : 50 182 644–50 182 783, 140 basesExon 10 : 50 182 904–50 183 018, 115 basesExon 11 : 50 183 186–50 183 255, 70 basesExon 12 : 50 183 420–50 183 564, 145 basesExon 13 : 50 184 592–50 184 814, 223 basesExon 14 : 50 185 443–50 185 531, 89 basesExon 15 : 50 185 666–50 185 707, 42 basesExon 16 : 50 185 889–50 186 046, 158 basesExon 17 : 50 186 281–50 186 348, 68 basesExon 18 : 50 186 613–50 186 746, 134 basesExon 19 : 50 187 705–50 189 075, 1 371 bases151015195′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,6 kb sur les 33,8 kb du gène ; 2 358 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SEMA3F : semaphorin 3F. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sema3f

Vancouver

Dante Labs. Gène SEMA3F : semaphorin 3F [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sema3f

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