Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

SCNM1

sodium channel modifier 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
1q21.3
Koordinaadid
Kromosoom 1: 151 166 144–151 170 296 (GRCh38)
Eksonid
7 eksonit, ulatus 4,2 kb
Valk
230 aminohapet
Tuntud ka kui
MGC3180
MANE Select transkript
ENST00000368905.9NM_024041.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SCNM1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SCNM1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 1, millel on sulg kohal, kus asub SCNM1. SCNM1 ja sellele lähedal asuvad 32 geeni kromosoomil 1, vahemikus 150 668 220 kuni 151 668 219.Kromosoom 11q21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44150,8 Mb151 Mb151,2 Mb151,4 Mb151,6 MbGOLPH3L: 150 638 727–150 697 222, pöördne ahelGOLPH3LHORMAD1: 150 698 059–150 720 895, pöördne ahelHORMAD1CTSS: 150 730 079–150 765 957, pöördne ahelCTSSCTSK: 150 794 880–150 809 577, pöördne ahelCTSKARNT: 150 808 617–150 876 771, pöördne ahelARNTCTXND2: 150 887 136–150 913 292, otsene ahelCTXND2SETDB1: 150 926 263–150 964 748, otsene ahelSETDB1CERS2: 150 959 099–150 977 396, pöördne ahelCERS2ANXA9: 150 981 321–150 996 077, otsene ahelANXA9MINDY1: 150 995 125–151 008 376, pöördne ahelPRUNE1: 151 008 408–151 035 714, otsene ahelBNIPL: 151 036 321–151 047 720, otsene ahelC1orf56: 151 047 746–151 051 986, otsene ahelC1orf56CDC42SE1: 151 050 242–151 070 325, pöördne ahelCDC42SE1MLLT11: 151 054 177–151 069 544, otsene ahelMLLT11GABPB2: 151 070 514–151 130 109, otsene ahelGABPB2SEMA6C: 151 131 685–151 147 813, pöördne ahelTIPE2: 151 156 621–151 160 255, otsene ahelTIPE2LYSMD1: 151 159 748–151 165 948, pöördne ahelLYSMD1SCNM1: 151 166 144–151 170 296, otsene ahelSCNM1TMOD4: 151 169 984–151 176 284, pöördne ahelTMOD4VPS72: 151 176 304–151 195 321, pöördne ahelPIP5K1A: 151 197 949–151 249 538, otsene ahelPSMD4: 151 254 709–151 279 502, otsene ahelPSMD4ZNF687: 151 281 502–151 292 180, otsene ahelZNF687PI4KB: 151 291 792–151 328 394, pöördne ahelPI4KBRFX5: 151 340 640–151 347 339, pöördne ahelRFX5SELENBP1: 151 364 157–151 372 716, pöördne ahelSELENBP1PSMB4: 151 399 556–151 401 941, otsene ahelPSMB4POGZ: 151 402 724–151 459 511, pöördne ahelPOGZCGN: 151 510 139–151 538 692, otsene ahelCGNTUFT1: 151 540 305–151 583 583, otsene ahelTUFT1SNX27: 151 611 985–151 699 091, otsene ahelSNX27SCNM1 skeem: 7 eksonit kromosoomi 1 otsene ahelalEkson 4: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 151 166 144–151 166 203, 60 alustEkson 2: 151 166 471–151 166 541, 71 alustEkson 3: 151 166 934–151 167 022, 89 alustEkson 4: 151 167 121–151 167 218, 98 alustEkson 5: 151 167 326–151 167 414, 89 alustEkson 6: 151 168 144–151 168 338, 195 alustEkson 7: 151 168 986–151 170 296, 1311 alust12345675′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,9 kb kogupikkusega 4,2 kb; neist 693 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse SCNM1

1

koht geenis SCNM1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SCNM1 4,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,9 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SCNM1 geen: sodium channel modifier 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/scnm1

Vancouver

Dante Labs. SCNM1 geen: sodium channel modifier 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/scnm1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test