Geeni
DKK1
dickkopf Wnt signaling pathway inhibitor 1
- HGNC 2891↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000107984↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 22943↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 10q21.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 10: 52 314 281–52 317 657 (GRCh38)
- Eksonit
- 4 eksonia 3,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 266 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- SK, DKK-1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000373970.4NM_012242.4
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dkk1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue DKK1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä DKK1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.
DKK1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,8 kb geenin 3,4 kb:stä; 801 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: DKK1
2Matala
Kuinka vaikea DKK1 on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100Jokainen palkki kuvaa sen osuutta DKK1-geenin eksonien emäksistä kyseisessä vaikeassa alueessa. Pisteet painottavat alueita sen mukaan, kuinka paljon kukin vaikeuttaa lyhyiden lukemien variantinkutsua: 0, kun mikään emäs ei kuulu mihinkään vaikeaan alueeseen, ja 100, kun jokainen emäs kuuluu kaikkiin niistä.
- KartoitettavuusAlueet, joilla 100 tai 250 emäsparin lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti, joten kutsu siellä voi puuttua tai olla virheellinen. Paino 35 %.0 %
- HomologiaSegmentaaliset duplikaatit: kopiot muualla genomissa, kuten paraloogit ja pseudogeenit, vähintään 90 %:n identtisyydellä. Paino 30 %.0 %
- ToistotTandeemitoistot ja saman emäksen toistuvat jaksot, joilla lukemat luistavat ja joita ne eivät välttämättä kata. Paino 15 %.2,1 %
- GC-pitoisuusIkkunat, joissa G- ja C-emästen osuus on alle 25 % tai yli 65 %, ja joita kirjastonvalmistus kattaa ohuesti. Paino 10 %.16 %
- Referenssin peittävyysLähellä olevan referenssikokoonpanon aukot, joissa ei ole sekvenssiä, johon lukemat voisivat kohdistua. Paino 10 %.0 %
Geeniin DKK1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita DKK1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Chiari type I malformation
- Headache
- Recurrent paroxysmal headache
- Abnormal gait
- Abnormal vestibulocochlear nerve morphology
- Abnormality of the eleventh cranial nerve
- Abnormality of the twelfth cranial nerve
- Cranial nerve compression
Näytä 14 piirrettä lisää
- Cranial nerve paralysis
- Distal peripheral sensory neuropathy
- Dysesthesia
- Fluid-filled cyst in spinal cord
- Inability to coordinate movements when walking
- Inability to move vocal cords
- Myelopathy
- Overactive lower leg reflex
- Progressive cerebellar ataxia
- Rise in pressure inside skull
- Somatic sensory dysfunction
- Babinski sign
- Brain stem compression
- Central sleep apnea
Abnormality of the musculoskeletal system
- Bone pain
- Osteoporosis
- Recurrent fractures
- Anteriorly placed odontoid process
- Cervical C2/C3 vertebral fusion
- Compression fracture of a vertebral body
- Fused neck
- Scoliosis
Näytä 3 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). DKK1-geeni: dickkopf Wnt signaling pathway inhibitor 1. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/dkk1
Dante Labs. DKK1-geeni: dickkopf Wnt signaling pathway inhibitor 1 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/dkk1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa