Abakaviirin yliherkkyys — HLA-B*57:01, geenimuunnos, jonka vuoksi abakaviiri toimii HIV-hoitona useimmille, mutta aiheuttaa mahdollisesti hengenvaarallisen yliherkkyysreaktion niille 5–8 prosentille eurooppalaisista, joilla tämä geenimuunnos on.
Koko genomin sekvensointi tarjoaa kattavan HLA-luokan I tyypityksen – mukaan lukien HLA-B*57:01-alleelin, jonka seulonta on FDA:n määräyksen mukaan suoritettava ennen abakaviirin määräämistä – sekä kaikki muut farmakogenomiikan kannalta merkitykselliset HLA-alleelit.
Abakaviirin yliherkkyys — HLA-B*57:01
Abakaviiri (Ziagen) on nukleosidinen käänteiskopioijaentsyymi-inhibiittori (NRTI), jota käytetään HIV-infektion yhdistelmähoidon keskeisenä osana. Noin 5–8 %:lla potilaista, joille on määrätty abakaviiria ilman edeltävää HLA-B*57:01-seulontaa, kehittyy mahdollisesti hengenvaarallinen yliherkkyysreaktio (HSR), jolle ovat ominaisia kuume, ihottuma, ruoansulatuskanavan oireet ja huonovointisuus, jotka alkavat hoidon ensimmäisten 6 viikon aikana. Potilailla, joilla kehittyy HSR ja jotka sitten vahingossa altistuvat uudelleen abakaviirille – esimerkiksi jos diagnoosia ei ole selkeästi dokumentoitu – reaktio voi olla vakava ja nopeasti kuolemaan johtava, ja siihen voi liittyä akuutti hypotensio ja monielinvaurio.
HLA-B*57:01-geenin ja abakaviirin yliherkkyyden välinen yhteys on yksi lääketieteen vahvimmista farmakogenomisista yhteyksistä. HLA-B*57:01-kantajilla, jotka saavat abakaviiria, on noin 50–60 %:n riski kehittää HSR, kun taas kantajilla riski on noin 0–1 %. Mekanismissa HLA-B*57:01-proteiini esittelee abakaviirin tai sen metaboliitteja osana peptidien sitoutumiskourua CD8+ T-soluille, mikä laukaisee polyklonaalisen sytotoksisen T-soluvasteen. HLA-B*57:01 esiintyy noin 5–8 %:lla eurooppalaista syntyperää olevista henkilöistä, 1–3 %:lla afrikkalaista syntyperää olevista henkilöistä ja alle 1 %:lla aasialaista syntyperää olevista henkilöistä, minkä vuoksi seulonta on erityisen merkittävää eurooppalaista syntyperää olevissa HIV-populaatioissa.
FDA lisäsi abakaviiriin vuonna 2008 kehystetyn varoituksen, jossa vaaditaan HLA-B*57:01-seulonta ennen abakaviirihoidon aloittamista tai sen yhteydessä. Myös WHO:n HIV-hoito-ohjeissa suositellaan HLA-B*57:01-seulontaa ennen abakaviirin käyttöä. Yleisen hoitoa edeltävän seulonnan käyttöönotto on vähentänyt immunologisesti vahvistettujen abakaviiriin liittyvien yliherkkyysreaktioiden esiintyvyyttä noin 50 prosentilla. Testi on HIV-hoidon standardi Yhdysvalloissa, Euroopan unionissa ja yhä useammin myös matalan ja keskitulotason maissa. HLA-B*57:01 liittyy myös flukloksasilliinin aiheuttamaan maksavaurioon ja karbamatsepiinin yliherkkyysriskiin, minkä vuoksi koko genomin sekvensoinnin avulla saatava täydellinen HLA-tyypitys on laajasti hyödyllistä potilaille, joilla on monimutkaiset lääkehoidot.
Markkinoilla on saatavilla yksittäisiä HLA-B*57:01-testejä, ja niiden käyttö on vakiintunut käytäntö ennen abakaviirin aloittamista. Koko genomin sekvensointi tarjoaa lisäksi kattavan HLA-tyypityksen, joka kattaa yhdellä testillä HLA-B*15:02-, HLA-B*58:01- ja muut kliinisesti merkitykselliset HLA-alleelit B*57:01:n ohella.
Kattava HLA-tyypitys kattaa useita elintärkeitä lääkeaineiden yliherkkyysalleeleja yhdellä tuloksella
HLA-B*57:01 on vain yksi monista HLA-alleeleista, joiden on todettu olevan yhteydessä lääkeaineiden yliherkkyyteen. HLA-B*15:02 (karbamatsepiini-SJS/TEN Kaakkois-Aasian väestöryhmissä), HLA-B*58:01 (allopurinoli-SJS/TEN), HLA-B*57:01 (flukloksasilliinin aiheuttama maksavaurio) ja HLA-A*31:01 (karbamatsepiinin yliherkkyys eurooppalaisilla) ovat kaikki kliinisesti merkityksellisiä alleeleja, joilla on selkeät maantieteelliset jakaumat ja lääkekohtaiset yhteydet. Potilaalla, joka saa useita lääkkeitä, voi olla useita merkityksellisiä HLA-farmakogenomisia seikkoja. Koko genomin sekvensointi suorittaa täydellisen korkean resoluution HLA-luokan I ja II tyypityksen — tarjoten täydellisen HLA-farmakogenomisen profiilin yhdellä testillä sen sijaan, että tilattaisiin erilliset yksittäisten alleelien testit jokaiselle merkitykselliselle lääkkeelle.
HLA-B*57:01-tulos on pysyvä – sama genomi, jonka perusteella ennustetaan abakaviirin riski, ohjaa myös lääkkeen määräämistä koko elämän ajan
Toisin kuin monet kliiniset laboratoriotulokset, jotka edellyttävät säännöllisiä uusintatestejä, HLA-genotyyppi määräytyy syntymän yhteydessä eikä muutu koskaan. Kerran saatu HLA-B*57:01-tulos – olipa se peräisin kohdennetusta testistä tai koko genomin sekvensoinnista – on voimassa koko elämän ajan. Abakaviirin määräämisen vasta-aihe pätee riippumatta HIV-hoidon vaiheesta tai liitännäissairauksista. HIV-potilailla, joiden hoito-ohjelmat saattavat muuttua vuosien varrella, HLA-genotyypin pysyvä kirjaaminen potilaskertomukseen varmistaa, että abakaviiria sisältäviä hoito-ohjelmia vältetään kaikissa tulevissa hoitopäätöksissä ilman, että testausta tarvitsee toistaa.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – esimerkiksi abakaviiriin liittyvän yliherkkyyden (HLA-B*57:01) sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, myös virtuaalisia potilasjärjestöjä.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
