Γονίδιο
ARHGEF9
Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9
- HGNC 14561↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000131089↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 23229↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- Xq11.1
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα X: 63.634.967–63.785.214 (GRCh38)
- Εξόνια
- 10 έξώνια σε 150,2 kb
- Πρωτεΐνη
- 523 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- KIAA0424, PEM-2
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000671741.2NM_001353921.2
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/arhgef9.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το ARHGEF9, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Επιληψία (Πλήρες Πάνελ)
- Σύνθετη Νευροαναπτυξιακή Διαταραχή Συνδεδεμένη με το Χρωμόσωμα X
Σύνθετη νευροαναπτυξιακή διαταραχή που μεταβιβάζεται με κληρονομικότητα συνδεδεμένη με το χρωμόσωμα X και χαρακτηρίζεται από διανοητική αναπηρία, αυτισμό και επιληψία.
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 5 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
- Επιληψία
Ένα από τα 171 γονίδια που συνδέονται με αυτό
Εγκεφαλική διαταραχή που χαρακτηρίζεται από επεισόδια παθολογικά αυξημένης νευρωνικής εκφόρτισης, που έχουν ως αποτέλεσμα παροδικά επεισόδια αισθητηριακής ή κινητικής νευρολογικής δυσλειτουργίας ή ψυχικής δυσλειτουργίας. Τα επεισόδια αυτά μπορεί να σχετίζονται ή να μην σχετίζονται με απώλεια συνείδησης ή σπασμούς.
- 4 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
Ευρύτερες ομάδες
Νοητική αναπηρία
Ένα από τα 233 γονίδια που συνδέονται με αυτό
- 4 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
Πώς είναι διαταγμένο το ARHGEF9
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 4,7 kb από τα 150,2 kb του γονιδίου· 1.572 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχηση του ARHGEF9
2Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι να αλληλουχηθεί το ARHGEF9 με σύντομα αναγνώσματα, από το 100
0 · Εύκολο100 · Δύσκολο
Σχεδόν όλα τα εξόνια του ARHGEF9 βρίσκονται σε σημεία όπου τα σύντομα αναγνώσματα αντιστοιχίζονται καθαρά.
Τι προσθέτει: το ποσοστό των εξονίων του ARHGEF9 σε κάθε είδος δύσκολης περιοχής
- ΧαρτογραφησιμότηταΤμήματα όπου αναγνώσματα των 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι λανθασμένη. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 100.0%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παραλόγοι και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή μεγαλύτερη. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 60.0%
- Κοινό με το chrYΟι ψευδοαυτοσωμικές περιοχές και η περιοχή X-transposed, όπου τα chrX και chrY φέρουν την ίδια ή σχεδόν την ίδια αλληλουχία, οπότε ένα ανάγνωσμα από το ένα μπορεί να τοποθετηθεί στο άλλο. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 60.0%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στο κοντινό σύνθετο γονιδίωμα αναφοράς, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία τα αναγνώσματα μπορούν να ευθυγραμμιστούν. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 50.0%
- ΕπαναλήψειςTandem επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες τα αναγνώσματα ολισθαίνουν και ενδέχεται να μην τις καλύπτουν πλήρως. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 30.4,1%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει αραιά. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 20.2%
Βαθμολογία της Dante Labs από δική μας έρευνα, βασισμένη στους χάρτες δύσκολα αλληλουχούμενων περιοχών Genome in a Bottle του NIST.Πώς βαθμολογείταιΚάθε ράβδος είναι το ποσοστό των βάσεων των εξονίων του ARHGEF9 σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Κάθε είδος μπορεί από μόνο του να κάνει ένα γονίδιο δύσκολο, και καθένα επιπλέον προσθέτει λιγότερο: 0 όταν καμία βάση δεν βρίσκεται σε κάποια, 100 όταν κάθε βάση βρίσκεται εκεί όπου τα αναγνώσματα δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά.
36
θέσεις στο ARHGEF9 όπου το ClinVar κατατάσσει μια αλλαγή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που τα σύντομα αναγνώσματα δυσκολεύονται να καλύψουν.
Ένα πλήρες γονιδίωμα καλύπτει και τα 150,2 kb του ARHGEF9, συμπεριλαμβανομένων των intronic περιοχών, και όχι μόνο τα 4,7 kb των εξονίων.
ClinVar pathogenic variants (37)
The ARHGEF9 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Παθογόνο 25
- Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο 2
- Πιθανώς παθογόνο 10
| Παραλλαγή | Conditions | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1306del (p.Glu436fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.886C>T (p.Arg296Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.332G>A (p.Arg111Gln) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.890G>A (p.Arg297His) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.582+1G>A (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1423dup (p.Tyr475fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1409C>G (p.Ser470Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1351C>T (p.Gln451Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1269G>A (p.Trp423Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1150G>T (p.Glu384Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1138_1141del (p.Val380fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1115G>A (p.Arg372His) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1099del (p.Leu367fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1033C>T (p.Arg345Trp) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.1030C>T (p.Gln344Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.982_983dup (p.Gly330fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.945G>A (p.Glu315=) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.942G>A (p.Trp314Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.928_935del (p.Ser310fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.922C>T (p.Gln308Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.920G>A (p.Trp307Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.813_814del (p.His271fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.775C>T (p.Gln259Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.556G>A (p.Glu186Lys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001353921.2(ARHGEF9):c.402+1G>C (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
See all 37 with every other ARHGEF9 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- PCDH19protocadherin 19Μοιράζεται 3 παθήσεις
- SYN1synapsin IΜοιράζεται 3 παθήσεις
- ARXaristaless related homeoboxΜοιράζεται 2 παθήσεις
- ATP6AP2ATPase H+ transporting accessory protein 2Μοιράζεται 2 παθήσεις
- CLCN4Cl-/H+ antiporter 4Μοιράζεται 2 παθήσεις
- CNKSR2connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2Μοιράζεται 2 παθήσεις
- FGF13fibroblast growth factor 13Μοιράζεται 2 παθήσεις
- FRMPD4FERM and PDZ domain containing 4Μοιράζεται 2 παθήσεις
- FTSJ1FtsJ RNA 2'-O-methyltransferase 1Μοιράζεται 2 παθήσεις
- GRIA3glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3Μοιράζεται 2 παθήσεις
- GRIN1glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 1Μοιράζεται 2 παθήσεις
- GRIN2Bglutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2BΜοιράζεται 2 παθήσεις
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το ARHGEF9
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το ARHGEF9. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-19: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.19-9814e911.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο ARHGEF9: Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9. Ανάκτηση 19 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/arhgef9
Dante Labs. Γονίδιο ARHGEF9: Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9 [Internet]. [ανακτήθηκε 19 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/arhgef9
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες