Gen
FNIP1
folliculin interacting protein 1
- HGNC 29418↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000217128↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 96459↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 5q31.1
- Koordinater
- Kromosom 5: 131 641 714–131 797 017 (GRCh38)
- Exoner
- 18 exoner på 155,3 kb
- Protein
- 1 166 aminosyror
- Även känd som
- KIAA1961
- MANE Select-transkript
- ENST00000510461.6NM_133372.3
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/fnip1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs FNIP1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Andra medfödda immunbristsjukdomar
- Immunbristsjukdom
En av 170 gener kopplade till den
Sjukdom där det finns en brist eller defekt i immunförsvarets mekanismer, antingen cellulära eller humorala.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
HSCT vid SCID och allvarliga PID; immunglobulinersättning (IVIG/SCIG) vid antikroppsbrist; leniolisib (Joenja, FDA 2023) vid APDS; genterapi vid ADA-SCID; abatacept vid CTLA4- och LRBA-brist; profylaktiska antibiotika; G-CSF vid CGD
Så är FNIP1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 6,6 kb av genens 155,3 kb, och 3 501 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av FNIP1
2Låg
Hur svår FNIP1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av FNIP1s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.4,6 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.11 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
2
positioner i FNIP1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 155,3 kb av FNIP1, inklusive introner, inte bara de 6,6 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ADAadenosine deaminaseDelar 1 tillstånd
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDelar 1 tillstånd
- AK2adenylate kinase 2Delar 1 tillstånd
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BDelar 1 tillstånd
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Delar 1 tillstånd
- ATMATM serine/threonine kinaseDelar 1 tillstånd
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Delar 1 tillstånd
- B2Mbeta-2-microglobulinDelar 1 tillstånd
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Delar 1 tillstånd
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDelar 1 tillstånd
- BCL11BBCL11 transcription factor BDelar 1 tillstånd
- BLNKB cell linkerDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till FNIP1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som FNIP1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.18-e609d43e.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). FNIP1-genen: folliculin interacting protein 1. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/fnip1
Dante Labs. FNIP1-genen: folliculin interacting protein 1 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/fnip1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor