Gen
CYP26B1
cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1
- HGNC 20581↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000003137↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 56603↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 2p13.2
- Koordinater
- Kromosom 2: 72 129 238–72 147 862 (GRCh38)
- Exoner
- 6 exoner på 18,6 kb
- Protein
- 512 aminosyror, 57,5 kDa
- Även känd som
- P450RAI-2
- MANE Select-transkript
- ENST00000001146.7NM_019885.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Share this page
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cyp26b1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs CYP26B1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Syndromisk kraniosynostos
Tillstånd som kombinerar för tidig slutning av skallsuturer med andra kännetecken, bland annat syndromen Apert, Crouzon, Pfeiffer, Muenke och Saethre-Chotzen, orsakade av gener som FGFR2, FGFR3, FGFR1, TWIST1, TCF12 och ERF.
- ClinGen bedömer kopplingen som måttlig
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Tidig diagnos gör det möjligt att operera i rätt tid och följa huvudets tillväxt, syn och hörsel; mildare former, såsom Muenke-syndromet, kan förbli oupptäckta hos vuxna, vilket är relevant för familjeplanering.
Så är CYP26B1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,6 kb av genens 18,6 kb, och 1 539 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av CYP26B1
9Lätt
Hur svår CYP26B1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i CYP26B1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som tillkommer: andelen av CYP26B1s exoner i varje typ av svår region
- KartläggbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 100.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- Delas med chrYDe pseudoautosomala regionerna och den X-transponerade regionen, där chrX och chrY bär samma eller nästan samma sekvens, så en läsning från den ena kan placeras på den andra. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassemblyn, där det inte finns någon sekvens för läsningarna att anpassas mot. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 50.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, där läsningar glider och som kanske inte spänns över. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 30.4,1 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker glest. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 20.38 %
Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts detVarje stapel är andelen av CYP26B1s exonbaser i den typen av svår region. Varje enskild typ kan göra en gen svår på egen hand, och varje ytterligare typ lägger till mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
5
positioner i CYP26B1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsprov täcker alla 18,6 kb av CYP26B1, inklusive introner, och inte bara de 4,6 kb exoner.
ClinVar-patogena varianter (5)
De CYP26B1-varianter som ClinVar klassificerar som patogena eller sannolikt patogena för något tillstånd, granskade av minst en inlämnare med angivna kriterier, samt de mest granskade av dem. Det är ClinVars offentliga register över genen, aldrig ett resultat.
- Patogen 3
- Sannolikt patogen 2
| Variant | Tillstånd | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_019885.4(CYP26B1):c.1208C>T (p.Ala403Val) | lethal occipital encephalocele-skeletal dysplasia syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_019885.4(CYP26B1):c.1146+2T>C | lethal occipital encephalocele-skeletal dysplasia syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_019885.4(CYP26B1):c.3G>T (p.Met1Ile) | lethal occipital encephalocele-skeletal dysplasia syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_019885.4(CYP26B1):c.1190G>A (p.Arg397Gln) | lethal occipital encephalocele-skeletal dysplasia syndrome | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_019885.4(CYP26B1):c.86C>A (p.Ser29Ter) | lethal occipital encephalocele-skeletal dysplasia syndrome | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Gener kopplade till samma tillstånd
- ERFETS2 repressor factorDelar 1 tillstånd
- FGFR1fibroblast growth factor receptor 1Delar 1 tillstånd
- FGFR2fibroblast growth factor receptor 2Delar 1 tillstånd
- FGFR3fibroblast growth factor receptor 3Delar 1 tillstånd
- IFT122intraflagellar transport 122Delar 1 tillstånd
- IFT43intraflagellar transport 43Delar 1 tillstånd
- IFT52intraflagellar transport 52Delar 1 tillstånd
- IL11RAinterleukin 11 receptor subunit alphaDelar 1 tillstånd
- KAT6Alysine acetyltransferase 6ADelar 1 tillstånd
- MEGF8multiple EGF like domains 8Delar 1 tillstånd
- MSX2msh homeobox 2Delar 1 tillstånd
- PORcytochrome p450 oxidoreductaseDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till CYP26B1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som CYP26B1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-21: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.21-777c9289.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). CYP26B1-genen: cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1. Hämtad 21 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/cyp26b1
Dante Labs. CYP26B1-genen: cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 [Internet]. [citerad 21 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/cyp26b1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor