Gene
ARHGEF15
Rho guanine nucleotide exchange factor 15
- HGNC 15590↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000198844↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 22899↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 17p13.1
- Coordenadas
- Cromossoma 17: 8 310 241–8 322 511 (GRCh38)
- Exões
- 16 exões ao longo de 12,3 kb
- Proteína
- 841 aminoácidos
- Também conhecido como
- KIAA0915, Vsm-RhoGEF, ARGEF15, FLJ13791, MGC44868
- Transcrito MANE Select
- ENST00000361926.8NM_173728.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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Como ARHGEF15 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 4,2 kb dos 12,3 kb do gene; 2526 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de ARHGEF15
3Baixo
Grau de dificuldade de sequenciar ARHGEF15 com leituras curtas, em 100Cada barra é a proporção das bases de exões de ARHGEF15 que estão nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem para uma chamada de leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não abranger. Peso 15%.1,5%
- Teor de GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre mal. Peso 10%.24%
- Cobertura de referênciaLacunas na montagem de referência próxima, onde não há sequência à qual as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
Características associadas a ARHGEF15
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que ARHGEF15 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene ARHGEF15: Rho guanine nucleotide exchange factor 15. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/arhgef15
Dante Labs. Gene ARHGEF15: Rho guanine nucleotide exchange factor 15 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/arhgef15
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