Gen
PTPRQ
protein tyrosine phosphatase receptor type Q
- HGNC 9679↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000139304↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 374462↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 12q21.31
- Koordinater
- Kromosom 12: 80 444 235–80 680 273 (GRCh38)
- Eksoner
- 45 eksoner over 236 kb
- Protein
- 2 299 aminosyrer
- Tidligere symboler
- DFNB84
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000644991.3NM_001145026.2
- Lokustype
- Protein-coding
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ptprq.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes PTPRQ og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Hørselstap og døvhet
- Autosomal dominant ikke-syndromisk hørselstapAutosomal dominant
Autosomal dominant form for ikke-syndromisk døvhet.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
- Ikke-syndromisk genetisk hørselstap
Ett av 97 gener knyttet til den
Arvelig hørselstap uten andre medisinske trekk, inkludert de vanlige recessive formene forårsaket av GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC og mange andre gener, samt dominante, X-bundne og mitokondrielle former.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 5 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Kunnskap om den genetiske årsaken kan veilede valg av hørselshjelpemidler og cochleaimplantat, vurdering av om du kan delta i genterapistudier (for eksempel OTOF), og familieveiledning.
Slik er PTPRQ bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 8,3 kb av genets 236 kb, og 6 900 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av PTPRQ
45
posisjoner i PTPRQ der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
En helgenomsekvensering dekker alle 236 kb av PTPRQ, inkludert introner, ikke bare de 8,3 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ACTG1actin gamma 1Deler 2 tilstander
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ADeler 2 tilstander
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Deler 2 tilstander
- CD164CD164 moleculeDeler 2 tilstander
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentDeler 2 tilstander
- COCHcochlinDeler 2 tilstander
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainDeler 2 tilstander
- COL11A2collagen type XI alpha 2 chainDeler 2 tilstander
- DIAPH1diaphanous related formin 1Deler 2 tilstander
- EYA4EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4Deler 2 tilstander
- GJB2gap junction protein beta 2Deler 2 tilstander
- GJB6gap junction protein beta 6Deler 2 tilstander
Egenskaper knyttet til PTPRQ
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene PTPRQ kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). PTPRQ-genet: protein tyrosine phosphatase receptor type Q. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/ptprq
Dante Labs. PTPRQ-genet: protein tyrosine phosphatase receptor type Q [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/ptprq
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker