Gen
PPFIBP1
PPFIB scaffold protein 1
- HGNC 9249↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000110841↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 8496↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 12p11.23-p11.22
- Coördinaten
- Chromosoom 12: 27.524.206–27.695.564 (GRCh38)
- Exons
- 30 exons over 171,4 kb
- Eiwit
- 1.005 aminozuren
- Ook bekend als
- L2, hSGT2, hSgt2p, SGT2, liprin-beta1
- MANE Select-transcript
- ENST00000228425.11NM_003622.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees PPFIBP1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geen enkel Genome Test-rapport leest PPFIBP1 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.
Opbouw van PPFIBP1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 6 kb van de 171,4 kb van het gen; 3.018 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest PPFIBP1 leest
6
posities in PPFIBP1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
4 daarvan (67%) vallen in gebieden die korte reads moeilijk vinden.
- Segmental duplications (4 posities)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Een volledig genoom dekt alle 171,4 kb van PPFIBP1, inclusief introns, en niet alleen de 6 kb aan exonen.
Kenmerken gekoppeld aan PPFIBP1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die PPFIBP1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- CNS demyelination
- Periventricular leukomalacia
- Absent speech development
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Motor delay
- Epileptic spasm
- Generalized-onset seizure
Toon 15 kenmerken meer
- Leukoencephalopathy
- Myoclonic seizure
- Seizure affecting one half of brain
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Dystonia
- Fewer and broader ridges in brain
- Focal impaired awareness seizure
- Frontal polymicrogyria
- Gray matter heterotopia
- Hypsarrhythmia
- Tonic seizure
- Ventriculomegaly
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). PPFIBP1-gen: PPFIB scaffold protein 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/ppfibp1
Dante Labs. PPFIBP1-gen: PPFIB scaffold protein 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/ppfibp1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken