유전자
SHANK2
SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2
요약
- 세포유전학적 위치
- 11q13.3-q13.4
- 좌표
- 염색체 11: 70,467,854–71,252,577 (GRCh38)
- 엑손
- 엑손 26개, 784.7 kb에 걸쳐
- 단백질
- 아미노산 1,849개
- 다른 이름
- CTTNBP1, ProSAP1, SHANK, SPANK-3
- 이전 기호
- CORTBP1
- MANE Select 전사체
- ENST00000601538.6NM_012309.5
- 유전자좌 유형
- gene with protein product
- Very high
- Confident
- Low
- Very low
기준 게놈GRCh38hg38
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이 유전자와 관련된 큐레이션 보고서
자폐 스펙트럼 장애
- 자폐증, 감수성(단일 유전자 형태)
NLGN3, NLGN4X, PTCHD1, SHANK2, TBR1, CHD8 변이를 포함한 자폐증에 대한 단일 유전자의 기여도입니다.
- 3명의 GenCC 제출자가 확정적 또는 강함으로 평가합니다
SHANK2의 구조
- 코딩 서열
- 비번역 영역
- 인트론
- 전사 방향
- 알려진 질병 유발 부위
- 짧은 리드가 판독하기 어려운 구간
v1.5 릴리스 기준, 이 유전자의 MANE Select 전사체 엑손이며 NCBI와 EMBL-EBI 자료를 바탕으로 하고 GRCh38 참조 게놈에 기반합니다.
Chromosome bands from UCSC's GRCh38 ideogram (2022-10-29).
Nearby genes from Ensembl release 116, on GRCh38.
유전자 전체 784.7 kb 중 엑손이 10.8 kb를 차지하며, 이 중 5,550개의 염기가 단백질을 암호화합니다.
전장 유전체 검사가 SHANK2 유전자를 읽는 방법
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SHANK2 내 위치 중 ClinVar가 병원성 또는 가능성 높은 병원성으로 분류하는 위치
이 중 어느 곳도 짧은 리드가 판독하기 어려운 구간에 있지 않습니다.
전장 유전체 검사는 인트론을 포함해 SHANK2의 전체 784.7kb를 모두 포함하며, 엑손 10.8kb만 보는 것이 아닙니다.
같은 질환과 연관된 유전자
외부 링크
단백질
이 정보의 출처
- HGNC: 유전자의 기호, 명칭, 다른 기호 및 위치입니다.
- NCBI와 EMBL-EBI의 MANE Select v1.5: 전사체, 엑손 및 코딩 서열입니다.
- GenCC와 ClinGen, 2026-10-16 공개본: 해당 유전자와 연관된 질환과 그 연관성의 강도입니다.
- ACMG 이차 소견 목록, SF v3.2입니다.
- ClinVar와 GIAB 층화 자료: 알려진 질병 유발 부위와 짧은 리드(short read)로 분석하기 어려운 영역입니다.
- 데이터 릴리스 2026.10.16-c6eea6bf.
Cite this page
Dante Labs. (n.d.). SHANK2 gene: SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2. Retrieved 2026년 10월 16일, from https://dantelabs.com/ko/genes/shank2
Dante Labs. SHANK2 gene: SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 [Internet]. [cited 2026년 10월 16일]. Available from: https://dantelabs.com/ko/genes/shank2
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