Gene
LHX3
LIM homeobox 3
- HGNC 6595↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000107187↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 8022↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 9q34.3
- Coordinate
- Cromosoma 9: 136.196.250–136.205.128 (GRCh38)
- Esoni
- 6 esoni su 8,9 kb
- Proteina
- 397 amminoacidi
- Trascritto MANE Select
- ENST00000371748.10NM_178138.6
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Ipogonadismo ipogonadotropo
Funzionalità ovarica o testicolare anomala dovuta a un'insufficiente stimolazione ormonale da parte dell'asse ipotalamo-ipofisario.
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Deficit combinato di ormoni ipofisari non acquisito
- Deficit combinato di ormoni ipofisari, forma genetica
Deficit ereditario di più ormoni ipofisari, inclusi PROP1, POU1F1, HESX1 e altre cause correlate.
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
L'ipopituitarismo congenito è caratterizzato da un deficit multiplo di ormoni ipofisari, che comprende carenze a livello somatotropo, tireotropo, lattotropo, corticotropo o gonadotropo, dovuto a mutazioni dei fattori di trascrizione implicati nell'ontogenesi dell'ipofisi.
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di LHX3
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 2,4 kb dei 8,9 kb del gene; 1194 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge LHX3
25
posizioni in LHX3 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 8,9 kb di LHX3, introni inclusi, non solo i 2,4 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- LHX4LIM homeobox 4Condivide 3 condizioni
- FOXA2forkhead box A2Condivide 2 condizioni
- GH1growth hormone 1Condivide 2 condizioni
- GHRHRgrowth hormone releasing hormone receptorCondivide 2 condizioni
- HESX1HESX homeobox 1Condivide 2 condizioni
- OTX2orthodenticle homeobox 2Condivide 2 condizioni
- POU1F1POU class 1 homeobox 1Condivide 2 condizioni
- PROP1PROP paired-like homeobox 1Condivide 2 condizioni
- RBM28RNA binding motif protein 28Condivide 2 condizioni
- RNPC3RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3Condivide 2 condizioni
- ROBO1roundabout guidance receptor 1Condivide 2 condizioni
- SOX3SRY-box transcription factor 3Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a LHX3
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che LHX3 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the endocrine system
- Decreased response to growth hormone stimulation test
- Decreased thyroid-stimulating hormone level
- Gonadotropin deficiency
- Hypothalamic luteinizing hormone-releasing hormone deficiency
- Low thyroid gland function due to abnormal pituitary gland
- Reduced radioactive iodine uptake
- Underdeveloped pituitary gland
- Decreased circulating T4 concentration
Mostra altri 12 tratti
- Hypopituitarism
- Panhypopituitarism
- Reduced circulating prolactin concentration
- Small thyroid gland
- Adrenocorticotropic hormone deficiency
- Decreased circulating ACTH concentration
- Decreased circulating follicle stimulating hormone concentration
- Decreased circulating luteinizing hormone level
- Ectopic posterior pituitary
- Hypogonadotropic hypogonadism
- Inappropriate antidiuretic hormone secretion
- Anterior hypopituitarism
Abnormality of head or neck
- Short neck
- Abnormally large tongue
- Delayed cranial suture closure
- Facial puffiness
- Large posterior fontanelle
- Abnormal facial shape
- Depressed nasal bridge
- Midface retrusion
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene LHX3: LIM homeobox 3. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/lhx3
Dante Labs. Gene LHX3: LIM homeobox 3 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/lhx3
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