Gén
SLC30A2
solute carrier family 30 member 2
- HGNC 11013↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000158014↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 7780↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 1p36.11
- Koordináták
- 1. kromoszóma: 26 037 252–26 046 118 (GRCh38)
- Exonok
- 8 exon, összesen 8,9 kb
- Fehérje
- 372 aminosav
- Korábbi jelölések
- ZNT2
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000374276.4NM_001004434.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc30a2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a SLC30A2-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Acrodermatitis Enteropathica
- Transient Neonatal Zinc DeficiencyAutoszomális domináns
Zinc deficiency in breastfed infants caused by SLC30A2 variants in the mother that reduce zinc in breast milk; the variant is found in the mother, not the infant, and the infant's symptoms resemble acrodermatitis enteropathica.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing allows zinc supplementation for affected infants and planning for future breastfed children.
A SLC30A2 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 8,9 kb-jából 3,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1119 bázis kódolja a fehérjét.
SLC30A2 szekvenálása
2
a SLC30A2 génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a SLC30A2 mind a 8,9 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 3,2 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (2)
The SLC30A2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Valószínűleg patogén 2
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_001004434.3(SLC30A2):c.838+2T>C (opens in a new tab) | zinc deficiency, transient neonatal | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001004434.3(SLC30A2):c.528del (p.Thr177fs) (opens in a new tab) | zinc deficiency, transient neonatal | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
A(z) SLC30A2 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) SLC30A2 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-18 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.18-8b139e39.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). SLC30A2 gén: solute carrier family 30 member 2. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/slc30a2
Dante Labs. SLC30A2 gén: solute carrier family 30 member 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/slc30a2
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt