Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

SATB1

SATB homeobox 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
3p24.3
Koordinaatit
Kromosomi 3: 18 345 377–18 425 339 (GRCh38)
Eksonit
11 eksonia 80 kb:n alueella
Proteiini
763 aminohappoa
MANE Select -transkripti
ENST00000338745.11NM_002971.6
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SATB1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

SATB1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 3, jossa hakasulke osoittaa SATB1-geenin sijainnin. SATB1 ja 1 geeni sen läheisyydessä kromosomissa 3, välillä 17 885 358–18 885 357.Kromosomi 33p24.3p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2918 Mb18,2 Mb18,4 Mb18,6 Mb18,8 MbTBC1D5: 17 157 162–18 444 817, juoste taaksepäinTBC1D5SATB1: 18 345 377–18 425 339, juoste taaksepäinSATB1SATB1-kaavio: 11 eksonia kromosomin 3 juosteella, taaksepäinEksoni 11: 4 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 10: 5 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 8: 3 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 7: 5 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 5: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 4: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 2: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEkson 11: 18 345 377–18 349 682, 4 306 emästäEkson 10: 18 351 992–18 352 195, 204 emästäEkson 9: 18 378 170–18 378 325, 156 emästäEkson 8: 18 386 399–18 386 611, 213 emästäEkson 7: 18 394 462–18 394 916, 455 emästäEkson 6: 18 397 179–18 397 290, 112 emästäEkson 5: 18 415 111–18 415 234, 124 emästäEkson 4: 18 416 007–18 416 133, 127 emästäEkson 3: 18 416 902–18 417 078, 177 emästäEkson 2: 18 420 757–18 420 991, 235 emästäEkson 1: 18 423 627–18 425 339, 1 713 emästä1110864215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 7,8 kb geenin 80 kb:stä; 2 292 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä SATB1

21

SATB1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

Kokogenomi kattaa kaikki 80 kb geenistä SATB1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 7,8 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). SATB1-geeni: SATB homeobox 1. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/satb1

Vancouver

Dante Labs. SATB1-geeni: SATB homeobox 1 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/satb1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test