Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

SATB1

SATB homeobox 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
3p24.3
Koordinaadid
Kromosoom 3: 18 345 377–18 425 339 (GRCh38)
Eksonid
11 eksonit, ulatus 80 kb
Valk
763 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000338745.11NM_002971.6
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SATB1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SATB1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 3, millel on sulg kohal, kus asub SATB1. SATB1 ja sellele lähedal asuv 1 geen kromosoomil 3, vahemikus 17 885 358 kuni 18 885 357.Kromosoom 33p24.3p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2918 Mb18,2 Mb18,4 Mb18,6 Mb18,8 MbTBC1D5: 17 157 162–18 444 817, pöördne ahelTBC1D5SATB1: 18 345 377–18 425 339, pöördne ahelSATB1SATB1 skeem: 11 eksonit kromosoomi 3 pöördne ahelalEkson 11: 4 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 10: 5 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 8: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 7: 5 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 5: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 4: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 2: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 11: 18 345 377–18 349 682, 4306 alustEkson 10: 18 351 992–18 352 195, 204 alustEkson 9: 18 378 170–18 378 325, 156 alustEkson 8: 18 386 399–18 386 611, 213 alustEkson 7: 18 394 462–18 394 916, 455 alustEkson 6: 18 397 179–18 397 290, 112 alustEkson 5: 18 415 111–18 415 234, 124 alustEkson 4: 18 416 007–18 416 133, 127 alustEkson 3: 18 416 902–18 417 078, 177 alustEkson 2: 18 420 757–18 420 991, 235 alustEkson 1: 18 423 627–18 425 339, 1713 alust1110864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 7,8 kb kogupikkusega 80 kb; neist 2292 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse SATB1

21

kohad geenis SATB1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SATB1 80 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (7,8 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SATB1 geen: SATB homeobox 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/satb1

Vancouver

Dante Labs. SATB1 geen: SATB homeobox 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/satb1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test