Geeni
RTN4IP1
reticulon 4 interacting protein 1
- HGNC 18647↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000130347↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 84816↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 6q21
- Koordinaatit
- Kromosomi 6: 106 570 771–106 629 498 (GRCh38)
- Eksonit
- 9 eksonia 58,7 kb:n alueella
- Proteiini
- 396 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- Yim1, NIMP
- MANE Select -transkripti
- ENST00000369063.8NM_032730.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue RTN4IP1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnöllinen optikusneuropatia
- Perinnöllinen näkohermon surkastuma
Perinnöllinen näkohermon kuitujen menetys, useimmiten OPA1-geenin muutosten aiheuttama autosomaalinen dominantti näkohermon surkastuma, mukaan lukien harvinaisemmat OPA3-, DNM1L-, SSBP1- ja muiden geenien aiheuttamat muodot.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
RTN4IP1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,9 kb geenin 58,7 kb:stä; 1 191 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä RTN4IP1
7
RTN4IP1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 58,7 kb geenistä RTN4IP1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,9 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ACO2aconitase 2Yhteinen sairaus: 1
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Yhteinen sairaus: 1
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Yhteinen sairaus: 1
- DNM1Ldynamin 1LYhteinen sairaus: 1
- MT-ND1mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 1Yhteinen sairaus: 1
- MT-ND4mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 4Yhteinen sairaus: 1
- MT-ND5mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 5Yhteinen sairaus: 1
- MT-ND6mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 6Yhteinen sairaus: 1
- OPA1OPA1 mitochondrial dynamin like GTPaseYhteinen sairaus: 1
- OPA3outer mitochondrial membrane lipid metabolism regulator OPA3Yhteinen sairaus: 1
- SSBP1single stranded DNA binding protein 1Yhteinen sairaus: 1
- TMEM126Atransmembrane protein 126AYhteinen sairaus: 1
Geeniin RTN4IP1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita RTN4IP1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). RTN4IP1-geeni: reticulon 4 interacting protein 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rtn4ip1
Dante Labs. RTN4IP1-geeni: reticulon 4 interacting protein 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rtn4ip1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa