Geeni
NUP214
nucleoporin 214
- HGNC 8064↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000126883↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 8021↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 9q34.13
- Koordinaatit
- Kromosomi 9: 131 125 586–131 234 663 (GRCh38)
- Eksonit
- 36 eksonia 109,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 2 090 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- CAIN, CAN, D9S46E, N214
- MANE Select -transkripti
- ENST00000359428.10NM_005085.4
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nup214.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue NUP214 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä NUP214. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.
NUP214-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 7,6 kb geenin 109,1 kb:stä; 6 273 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
NUP214-geenin sekvensointi
2
kohtaa NUP214-geenissä, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Yksikään niistä ei osu alueelle, jolla lyhyet luennat ovat vaikeita.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 109,1 kb NUP214-geenistä, intronit mukaan lukien, eikä pelkästään 7,6 kb eksoneita.
ClinVar pathogenic variants (2)
The NUP214 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen 1
- Todennäköisesti patogeeninen 1
| Variantti | Conditions | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|
| NM_005085.4(NUP214):c.112C>T (p.Arg38Cys) (opens in a new tab) | encephalopathy, acute, infection-induced, susceptibility to, 9 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| NM_005085.4(NUP214):c.929T>C (p.Ile310Thr) (opens in a new tab) | encephalopathy, acute, infection-induced, susceptibility to, 9 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★1 tähti neljästä kriteerit annettu, yksi lähettäjä |
Geeniin NUP214 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita NUP214 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Extra-axial cerebrospinal fluid accumulation
- Generalized brain degeneration
- Grand mal seizures
- Increased reflexes
- Loss of developmental milestones
- Ataxia
Näytä 3 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut sairauksia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joita lyhyet lukemat pitävät vaikeina.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Tietojulkaisu 2026.10.18-8b139e39.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). NUP214-geeni: nucleoporin 214. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/nup214
Dante Labs. NUP214-geeni: nucleoporin 214 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/nup214
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa