Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

CAPN15

calpain 15

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
16p13.3
Koordinaadid
Kromosoom 16: 527 712–554 636 (GRCh38)
Eksonid
14 eksonit, ulatus 26,9 kb
Valk
1086 aminohapet
Varasemad tähised
SOLH
MANE Select transkript
ENST00000219611.7NM_005632.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni CAPN15 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas CAPN15 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 16, millel on sulg kohal, kus asub CAPN15. CAPN15 ja sellele lähedal asuvad 47 geeni kromosoomil 16, vahemikus 41 174 kuni 1 041 173.Kromosoom 1616p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.30,2 Mb0,4 Mb0,6 Mb0,8 Mb1 MbPOLR3K: 44 356–53 663, pöördne ahelSNRNP25: 53 817–60 009, otsene ahelSNRNP25RHBDF1: 58 058–78 176, pöördne ahelRHBDF1MPG: 77 007–136 889, otsene ahelMPGNPRL3: 79 387–138 720, pöördne ahelNPRL3HBZ: 142 728–154 503, otsene ahelHBM: 153 892–166 770, otsene ahelHBMHBA2: 172 021–173 910, otsene ahelHBA2HBA1: 176 660–177 527, otsene ahelHBA1HBQ1: 180 437–181 181, otsene ahelHBQ1LUC7L: 188 943–229 485, pöördne ahelLUC7LFAM234A: 234 521–272 183, otsene ahelRGS11: 268 301–275 980, pöördne ahelRGS11ARHGDIG: 280 386–283 010, otsene ahelARHGDIGPDIA2: 283 152–287 215, otsene ahelPDIA2AXIN1: 287 440–352 734, pöördne ahelAXIN1MRPL28: 365 449–371 289, pöördne ahelMRPL28PGAP6: 370 779–387 113, pöördne ahelPGAP6NME4: 396 725–410 367, otsene ahelNME4DECR2: 401 834–412 492, otsene ahelDECR2RAB11FIP3: 425 593–523 012, otsene ahelRAB11FIP3CAPN15: 527 712–554 636, otsene ahelCAPN15PRR35: 559 688–565 532, otsene ahelPRR35PIGQ: 566 995–584 121, otsene ahelPIGQNHLRC4: 567 000–569 495, otsene ahelNHLRC4RAB40C: 589 007–629 348, otsene ahelRAB40CWFIKKN1: 629 239–634 117, otsene ahelWFIKKN1METTL26: 634 412–636 378, pöördne ahelMETTL26MCRIP2: 636 817–648 475, otsene ahelMCRIP2WDR90: 649 287–667 837, otsene ahelRHOT2: 668 081–674 174, otsene ahelRHBDL1: 675 605–678 275, otsene ahelSTUB1: 679 980–682 870, otsene ahelJMJD8: 681 666–684 528, pöördne ahelWDR24: 684 614–690 444, pöördne ahelFBXL16: 692 498–705 860, pöördne ahelMETRN: 715 093–719 796, otsene ahelMETRNANTKMT: 720 581–722 590, otsene ahelANTKMTCCDC78: 722 581–726 954, pöördne ahelCCDC78HAGHL: 726 494–735 525, otsene ahelCIAO3: 729 721–741 329, pöördne ahelMSLN: 760 729–768 866, otsene ahelMSLNL: 769 428–782 054, pöördne ahelMSLNLRPUSD1: 784 974–788 406, pöördne ahelRPUSD1CHTF18: 788 046–800 737, otsene ahelCHTF18GNG13: 798 020–800 770, pöördne ahelLMF1: 853 618–981 318, pöördne ahelLMF1SOX8: 981 444–986 979, otsene ahelSOX8CAPN15 skeem: 14 eksonit kromosoomi 16 otsene ahelalEkson 4: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 7: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 9: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 527 712–528 029, 318 alustEkson 2: 533 946–533 998, 53 alustEkson 3: 536 029–536 142, 114 alustEkson 4: 546 817–548 287, 1471 alustEkson 5: 548 993–549 201, 209 alustEkson 6: 549 288–549 471, 184 alustEkson 7: 549 615–549 838, 224 alustEkson 8: 551 302–551 427, 126 alustEkson 9: 551 512–551 664, 153 alustEkson 10: 552 051–552 212, 162 alustEkson 11: 552 301–552 530, 230 alustEkson 12: 552 605–552 771, 167 alustEkson 13: 552 863–553 041, 179 alustEkson 14: 553 339–554 636, 1298 alust1510145′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,9 kb kogupikkusega 26,9 kb; neist 3261 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse CAPN15

3

kohad geenis CAPN15, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CAPN15 26,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,9 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). CAPN15 geen: calpain 15. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/capn15

Vancouver

Dante Labs. CAPN15 geen: calpain 15 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/capn15

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test