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Gene

CAPN15

calpain 15

Sintesi

Localizzazione citogenetica
16p13.3
Coordinate
Cromosoma 16: 527.712–554.636 (GRCh38)
Esoni
14 esoni su 26,9 kb
Proteina
1086 amminoacidi
Simboli precedenti
SOLH
Trascritto MANE Select
ENST00000219611.7NM_005632.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora CAPN15. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di CAPN15

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 16, con una parentesi dove si trova CAPN15. CAPN15 e 47 geni nelle vicinanze sul cromosoma 16, da 41.174 a 1.041.173.Cromosoma 1616p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.30,2 Mb0,4 Mb0,6 Mb0,8 Mb1 MbPOLR3K: 44.356–53.663, filamento inversoSNRNP25: 53.817–60.009, filamento direttoSNRNP25RHBDF1: 58.058–78.176, filamento inversoRHBDF1MPG: 77.007–136.889, filamento direttoMPGNPRL3: 79.387–138.720, filamento inversoNPRL3HBZ: 142.728–154.503, filamento direttoHBM: 153.892–166.770, filamento direttoHBMHBA2: 172.021–173.910, filamento direttoHBA2HBA1: 176.660–177.527, filamento direttoHBA1HBQ1: 180.437–181.181, filamento direttoHBQ1LUC7L: 188.943–229.485, filamento inversoLUC7LFAM234A: 234.521–272.183, filamento direttoRGS11: 268.301–275.980, filamento inversoRGS11ARHGDIG: 280.386–283.010, filamento direttoARHGDIGPDIA2: 283.152–287.215, filamento direttoPDIA2AXIN1: 287.440–352.734, filamento inversoAXIN1MRPL28: 365.449–371.289, filamento inversoMRPL28PGAP6: 370.779–387.113, filamento inversoPGAP6NME4: 396.725–410.367, filamento direttoNME4DECR2: 401.834–412.492, filamento direttoDECR2RAB11FIP3: 425.593–523.012, filamento direttoRAB11FIP3CAPN15: 527.712–554.636, filamento direttoCAPN15PRR35: 559.688–565.532, filamento direttoPRR35PIGQ: 566.995–584.121, filamento direttoPIGQNHLRC4: 567.000–569.495, filamento direttoNHLRC4RAB40C: 589.007–629.348, filamento direttoRAB40CWFIKKN1: 629.239–634.117, filamento direttoWFIKKN1METTL26: 634.412–636.378, filamento inversoMETTL26MCRIP2: 636.817–648.475, filamento direttoMCRIP2WDR90: 649.287–667.837, filamento direttoRHOT2: 668.081–674.174, filamento direttoRHBDL1: 675.605–678.275, filamento direttoSTUB1: 679.980–682.870, filamento direttoJMJD8: 681.666–684.528, filamento inversoWDR24: 684.614–690.444, filamento inversoFBXL16: 692.498–705.860, filamento inversoMETRN: 715.093–719.796, filamento direttoMETRNANTKMT: 720.581–722.590, filamento direttoANTKMTCCDC78: 722.581–726.954, filamento inversoCCDC78HAGHL: 726.494–735.525, filamento direttoCIAO3: 729.721–741.329, filamento inversoMSLN: 760.729–768.866, filamento direttoMSLNL: 769.428–782.054, filamento inversoMSLNLRPUSD1: 784.974–788.406, filamento inversoRPUSD1CHTF18: 788.046–800.737, filamento direttoCHTF18GNG13: 798.020–800.770, filamento inversoLMF1: 853.618–981.318, filamento inversoLMF1SOX8: 981.444–986.979, filamento direttoSOX8Diagramma di CAPN15: 14 esoni sul filamento diretto del cromosoma 16Esone 4: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 7: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 9: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 527.712–528.029, 318 basiEsone 2: 533.946–533.998, 53 basiEsone 3: 536.029–536.142, 114 basiEsone 4: 546.817–548.287, 1471 basiEsone 5: 548.993–549.201, 209 basiEsone 6: 549.288–549.471, 184 basiEsone 7: 549.615–549.838, 224 basiEsone 8: 551.302–551.427, 126 basiEsone 9: 551.512–551.664, 153 basiEsone 10: 552.051–552.212, 162 basiEsone 11: 552.301–552.530, 230 basiEsone 12: 552.605–552.771, 167 basiEsone 13: 552.863–553.041, 179 basiEsone 14: 553.339–554.636, 1298 basi1510145′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,9 kb dei 26,9 kb del gene; 3261 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge CAPN15

3

posizioni in CAPN15 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 26,9 kb di CAPN15, introni inclusi, non solo i 4,9 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CAPN15: calpain 15. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/capn15

Vancouver

Dante Labs. Gene CAPN15: calpain 15 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/capn15

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