Gen
GIGYF2
GRB10 interacting GYF protein 2
- HGNC 11960↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000204120↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 26058↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 2q37.1
- Koordinatlar
- Kromozom 2: 232.697.331–232.860.605 (GRCh38)
- Eksonlar
- 163,3 kb boyunca 29 ekson
- Protein
- 1.299 amino asit
- Diğer adları
- KIAA0642, GYF2
- Önceki semboller
- PERQ2, PERQ3, TNRC15, PARK11
- MANE Select transkripti
- ENST00000373563.9NM_001103146.3
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gigyf2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameGIGYF2 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Hiçbir Genome Test raporu GIGYF2 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.
GIGYF2 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 163,3 kb uzunluğunun 7,8 kb'sini oluşturur; bu bazların 3.900 tanesi proteini kodlar.
GIGYF2 dizilemesi
2Kolay
Kısa okumalarla GIGYF2 dizilemesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden
0 · Kolay100 · Zor
GIGYF2 geninin ekzonlarının neredeyse tamamı, kısa okumaların temiz biçimde eşleştiği yerlerde bulunuyor.
Buna katkıda bulunan etken: GIGYF2 geninin ekzonlarının her zorluk türündeki bölgelerde bulunan oranı
- Eşlenebilirlik100 veya 250 baz çiftlik okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik veya hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiGenomun başka yerlerindeki kopyalar, örneğin paralog ve psödogenler, %90 veya daha yüksek benzerlikle bulunan segmental duplikasyonlar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kayabildiği ve tam olarak kapsayamadığı ardışık tekrarlar ve tek bazın tekrarlandığı diziler. Ağırlık %15.%10
- GC içeriğiG ve C oranının %25'in altında veya %65'in üzerinde olduğu pencereler; kütüphane hazırlığı bu bölgeleri seyrek kapsar. Ağırlık %10.%3,9
- Referans kapsamıReferans birleştirmesindeki, okumaların hizalanabileceği dizi bulunmayan yakın boşluklar. Ağırlık %10.%0
Dante Labs'ın kendi araştırmasına dayanan bir Dante Labs puanı; NIST'in zor dizilenen bölgelere ilişkin Genome in a Bottle haritalarına dayanır.Puan nasıl hesaplanırHer çubuk, GIGYF2 geninin ekzon bazlarının o zor bölge türünde bulunan oranını gösterir. Puan, her bölgenin bir kısa okuma çağrısına ne kadar maliyet getirdiğine göre ağırlıklandırılır: hiçbir baz herhangi bir bölgede değilse 0, her baz tüm bölgelerdeyse 100.
GIGYF2 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, GIGYF2 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). GIGYF2 geni: GRB10 interacting GYF protein 2. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/gigyf2
Dante Labs. GIGYF2 geni: GRB10 interacting GYF protein 2 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/gigyf2
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde