Gene
GFRA1
GDNF family receptor alpha 1
- HGNC 4243↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000151892↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 2674↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 10q25.3
- Coordenadas
- Cromossoma 10: 116 056 925–116 273 206 (GRCh38)
- Exões
- 11 exões ao longo de 216,3 kb
- Proteína
- 465 aminoácidos
- Também conhecido como
- RETL1, GDNFR, GFR-ALPHA-1, RET1L, TRNR1
- Símbolos anteriores
- GDNFRA
- Transcrito MANE Select
- ENST00000355422.11NM_005264.8
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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page <- fromJSON(url)
page$gene$nameAnalise GFRA1, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Malformações Congénitas do Rim e do Trato Urinário
- Hipodisplasia/Aplasia Renal 4Autossómica recessiva
Rins pequenos, malformados ou ausentes, associados a variantes em GFRA1.
- 2 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
Como GFRA1 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Locais conhecidos associados a doença
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 9,2 kb dos 216,3 kb do gene; 1398 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de GFRA1
1Baixo
Grau de dificuldade de sequenciar GFRA1 com leituras curtas, em 100Cada barra é a proporção das bases de exões de GFRA1 que estão nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem para uma chamada de leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não abranger. Peso 15%.5,1%
- Teor de GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre mal. Peso 10%.6,4%
- Cobertura de referênciaLacunas na montagem de referência próxima, onde não há sequência à qual as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
1
posição em GFRA1 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Nenhuma delas se situa numa região difícil de analisar com leituras curtas.
Um genoma completo abrange os 216,3 kb de GFRA1, incluindo os intrões, e não apenas os 9,2 kb de exões.
Características associadas a GFRA1
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que GFRA1 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicados em 2026-10-17: as condições a que o gene está associado e a força dessa associação.
- A lista de achados secundários do ACMG, SF v3.2.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos que causam doença e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão de dados 2026.10.17-8666dff2.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene GFRA1: GDNF family receptor alpha 1. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/gfra1
Dante Labs. Gene GFRA1: GDNF family receptor alpha 1 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/gfra1
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