Gen
GFRA1
GDNF family receptor alpha 1
- HGNC 4243↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000151892↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 2674↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 10q25.3
- Coordenadas
- Cromosoma 10: 116.056.925–116.273.206 (GRCh38)
- Exones
- 11 exones en 216,3 kb
- Proteína
- 465 aminoácidos
- También conocido como
- RETL1, GDNFR, GFR-ALPHA-1, RET1L, TRNR1
- Símbolos anteriores
- GDNFRA
- Transcrito MANE Select
- ENST00000355422.11NM_005264.8
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
Esta página como datos
Añada .json a la dirección de la página, o solicite application/json, para leerla como JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gfra1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameAnalice GFRA1 y el resto de su genoma con una sola prueba.
Desde 449 $Envío gratuito · Resultados en 6–8 semanas
Obtener mi Genome TestInforme revisado relevante para este gen
Malformaciones congénitas del riñón y de las vías urinarias
- Hipodisplasia/aplasia renal 4Autosómica recesiva
Riñones pequeños, malformados o ausentes asociados a variantes en GFRA1.
- 2 remitentes de GenCC la clasifican como definitiva o fuerte
Estructura de GFRA1
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 9,2 kb de los 216,3 kb del gen; 1398 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de GFRA1
1Baja
Dificultad de secuenciar GFRA1 con lecturas cortas, sobre 100Cada barra es la proporción de las bases de exones de GFRA1 que se encuentran en ese tipo de región difícil. La puntuación las pondera según el coste de cada una para una llamada con lecturas cortas: 0 cuando ninguna base está en ninguna, 100 cuando todas las bases están en todas ellas.
- MapeabilidadTramos donde las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser incorrecta. Peso 35 %.0 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con una identidad del 90 % o superior. Peso 30 %.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y series de una sola base, en las que las lecturas se deslizan y pueden no abarcarlas. Peso 15 %.5,1 %
- Contenido GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, zonas que la preparación de biblioteca cubre escasamente. Peso 10 %.6,4 %
- Cobertura de referenciaHuecos en el ensamblaje de referencia cercano, donde no hay secuencia a la que alinear las lecturas. Peso 10 %.0 %
1
posición en GFRA1 donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
Ninguna de ellas cae en una región que lecturas cortas encuentran difícil.
Un genoma completo cubre los 216,3 kb de GFRA1, incluidos los intrones, no solo los 9,2 kb de exones.
Rasgos asociados a GFRA1
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que GFRA1 puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-17: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista de hallazgos secundarios del ACMG, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de los datos 2026.10.17-8666dff2.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen GFRA1: GDNF family receptor alpha 1. Consultado el 18 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/gfra1
Dante Labs. Gen GFRA1: GDNF family receptor alpha 1 [Internet]. [citado 18 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/gfra1
Una prueba. Respuestas para toda la vida.
Desde 449 $Envío gratuito · Resultados en 6–8 semanas