Gen
SLC25A3
solute carrier family 25 member 3
- HGNC 10989↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000075415↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 5250↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 12q23.1
- Koordinater
- Kromosom 12: 98 593 686–98 606 367 (GRCh38)
- Eksoner
- 8 eksoner over 12,7 kb
- Protein
- 361 aminosyrer
- Også kjent som
- PiC, PTP
- Tidligere symboler
- PHC
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000552981.6NM_002635.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc25a3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes SLC25A3 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Hypertrofisk kardiomyopati
- Autosomal dominant
Ett av 62 gener knyttet til den
En tilstand der hjertemuskelen er forstørret uten en åpenbar årsak. Forstørrelsen er vanligvis asymmetrisk og kan være assosiert med obstruksjon av utløpsveien fra hjertekammeret.
- 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Betablokkere, ikke-dihydropyridin-kalsiumkanalblokkere, begrensning av aktivitet, genetisk veiledning
Slik er SLC25A3 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 6 kb av genets 12,7 kb, og 1 086 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av SLC25A3
1Lav
Hvor vanskelig SLC25A3 er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av SLC25A3s eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0,6 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.3,6 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.3,6 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
1
posisjon i SLC25A3 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helt genom dekker alle 12,7 kb av SLC25A3, inkludert introner, og ikke bare de 6 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainDeler 1 tilstand
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Deler 1 tilstand
- ALPK3alpha kinase 3Deler 1 tilstand
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinaseDeler 1 tilstand
- CDKN1Ccyclin dependent kinase inhibitor 1CDeler 1 tilstand
- CSRP3cysteine and glycine rich protein 3Deler 1 tilstand
- DHHdesert hedgehog signaling moleculeDeler 1 tilstand
- DHX37DEAH-box helicase 37Deler 1 tilstand
- DMPKDM1 protein kinaseDeler 1 tilstand
- ERFETS2 repressor factorDeler 1 tilstand
- ETFAelectron transfer flavoprotein subunit alphaDeler 1 tilstand
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit betaDeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til SLC25A3
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene SLC25A3 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). SLC25A3-genet: solute carrier family 25 member 3. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/slc25a3
Dante Labs. SLC25A3-genet: solute carrier family 25 member 3 [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/slc25a3
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker