Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

LGI4

leucine rich repeat LGI family member 4

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
19q13.12
Koordinaadid
Kromosoom 19: 35 124 513–35 135 059 (GRCh38)
Eksonid
9 eksonit, ulatus 10,5 kb
Valk
537 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000310123.8NM_139284.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni LGI4 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas LGI4 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 19, millel on sulg kohal, kus asub LGI4. LGI4 ja sellele lähedal asuvad 33 geeni kromosoomil 19, vahemikus 34 629 786 kuni 35 629 785.Kromosoom 1919q13.12p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4334,8 Mb35 Mb35,2 Mb35,4 Mb35,6 MbSCGB2B2: 34 590 644–34 677 159, pöördne ahelSCGB2B2ZNF302: 34 677 084–34 687 065, otsene ahelZNF302ZNF181: 34 734 155–34 750 437, otsene ahelZNF181ZNF599: 34 758 073–34 773 253, pöördne ahelZNF599ZNF30: 34 926 887–34 945 172, otsene ahelZNF30ZNF792: 34 956 167–34 964 293, pöördne ahelZNF792GRAMD1A: 34 994 537–35 027 406, otsene ahelGRAMD1ASCN1B: 35 030 444–35 040 455, otsene ahelSCN1BHPN: 35 040 506–35 066 592, otsene ahelHPN: 35 106 510–35 124 297, otsene ahelFXYD3: 35 115 521–35 125 653, otsene ahelFXYD3LGI4: 35 124 513–35 135 059, pöördne ahelLGI4FXYD1: 35 133 987–35 143 109, otsene ahelFXYD1FXYD7: 35 143 148–35 154 303, otsene ahelFXYD5: 35 154 440–35 171 796, otsene ahelFXYD5FAM187B: 35 224 800–35 228 739, pöördne ahelFAM187BLSR: 35 248 330–35 267 967, otsene ahelLSRUSF2: 35 268 485–35 279 821, otsene ahelUSF2HAMP: 35 280 716–35 285 146, otsene ahelHAMPMAG: 35 291 647–35 316 932, otsene ahelMAGCD22: 35 319 261–35 347 361, otsene ahelCD22FFAR1: 35 347 902–35 353 864, otsene ahelFFAR1FFAR3: 35 358 348–35 360 489, otsene ahelFFAR3GPR42: 35 371 068–35 372 962, otsene ahelGPR42FFAR2: 35 443 907–35 451 767, otsene ahelFFAR2KRTDAP: 35 487 324–35 495 558, pöördne ahelKRTDAPDMKN: 35 497 220–35 513 704, pöördne ahelDMKNSBSN: 35 523 367–35 528 351, pöördne ahelSBSNGAPDHS: 35 533 455–35 545 319, otsene ahelGAPDHSTMEM147: 35 545 600–35 547 527, otsene ahelATP4A: 35 549 339–35 563 658, pöördne ahelATP4APMIS2: 35 586 161–35 587 296, otsene ahelPMIS2HAUS5: 35 612 735–35 625 355, otsene ahelHAUS5RBM42: 35 628 989–35 638 927, otsene ahelRBM42LGI4 skeem: 9 eksonit kromosoomi 19 pöördne ahelalEkson 8: 4 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 7: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 6: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 5: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 3: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 9: 35 124 513–35 125 507, 995 alustEkson 8: 35 126 270–35 126 775, 506 alustEkson 7: 35 126 853–35 127 017, 165 alustEkson 6: 35 131 386–35 131 555, 170 alustEkson 5: 35 131 789–35 131 860, 72 alustEkson 4: 35 131 971–35 132 042, 72 alustEkson 3: 35 133 693–35 133 764, 72 alustEkson 2: 35 134 033–35 134 104, 72 alustEkson 1: 35 134 511–35 135 059, 549 alust9876543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,7 kb kogupikkusega 10,5 kb; neist 1614 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse LGI4

9

kohad geenis LGI4, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni LGI4 10,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,7 kb).

Geeniga LGI4 seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida LGI4 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). LGI4 geen: leucine rich repeat LGI family member 4. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/lgi4

Vancouver

Dante Labs. LGI4 geen: leucine rich repeat LGI family member 4 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/lgi4

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test