Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

IVNS1ABP

influenza virus NS1A binding protein

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
1q25.3
Koordinaatit
Kromosomi 1: 185 296 388–185 317 243 (GRCh38)
Eksonit
15 eksonia 20,9 kb:n alueella
Proteiini
642 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
NS1-BP, HSPC068, NS-1, KIAA0850, ND1, KLHL39, ARA3
MANE Select -transkripti
ENST00000367498.8NM_006469.5
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti

    • Muut synnynnäiset immuunijärjestelmän häiriöt

      • Immuunipuutossairaus

        Yksi 170 siihen liittyvästä geenistä

        Sairaus, jossa immuniteettimekanismeissa on puutetta tai vikaa, joko solullisessa tai humoraalisessa immuniteetissa.

        • 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
        Toimenpidettävyys

        HSCT vakavan yhdistelmäimmuunipuutoksen (SCID) ja vakavien primaaristen immuunipuutosten hoitoon; immunoglobuliinikorvaushoito (IVIG/SCIG) vasta-ainepuutoksiin; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-oireyhtymään; geenihoito ADA-SCID-tautiin; abatasepti CTLA4- ja LRBA-puutoksiin; profylaktiset antibiootit; G-CSF krooniseen granulomatoottiseen sairauteen (CGD)

    IVNS1ABP-geenin rakenne

    • Koodaava jakso
    • Translatoimaton alue
    • Intron
    • Transkription suunta
    Kromosomi 1, jossa hakasulke osoittaa IVNS1ABP-geenin sijainnin. IVNS1ABP ja 5 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 1, välillä 184 806 816–185 806 815.Kromosomi 11q25.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44185 Mb185,2 Mb185,4 Mb185,6 Mb185,8 MbNIBAN1: 184 790 724–184 974 660, juoste taaksepäinNIBAN1RNF2: 185 044 865–185 102 850, juoste eteenpäinRNF2TRMT1L: 185 118 085–185 157 072, juoste taaksepäinTRMT1LSWT1: 185 156 103–185 292 205, juoste eteenpäinSWT1IVNS1ABP: 185 296 388–185 317 243, juoste taaksepäinIVNS1ABPHMCN1: 185 734 371–186 190 949, juoste eteenpäinHMCN1IVNS1ABP-kaavio: 15 eksonia kromosomin 1 juosteella, taaksepäinEkson 15: 185 296 388–185 298 288, 1 901 emästäEkson 14: 185 299 710–185 299 883, 174 emästäEkson 13: 185 299 999–185 300 130, 132 emästäEkson 12: 185 300 217–185 300 343, 127 emästäEkson 11: 185 300 437–185 300 558, 122 emästäEkson 10: 185 300 972–185 301 196, 225 emästäEkson 9: 185 301 434–185 301 563, 130 emästäEkson 8: 185 305 536–185 305 643, 108 emästäEkson 7: 185 307 014–185 307 139, 126 emästäEkson 6: 185 307 489–185 307 662, 174 emästäEkson 5: 185 308 800–185 308 875, 76 emästäEkson 4: 185 309 003–185 309 172, 170 emästäEkson 3: 185 309 383–185 309 511, 129 emästäEkson 2: 185 311 095–185 311 322, 228 emästäEkson 1: 185 316 953–185 317 243, 291 emästä15141210864215′3′

    Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

    Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

    Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

    Eksonit muodostavat 4,1 kb geenin 20,9 kb:stä; 1 929 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

    IVNS1ABP-geenin sekvensointi

    2Helppo

    Kuinka vaikea IVNS1ABP-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

    Lähes kaikki IVNS1ABP-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

    Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa IVNS1ABP-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

    • Kartoitettavuus0 %
    • Homologia0 %
    • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
    • Referenssin kattavuus0 %
    • Toistot2 %
    • GC-pitoisuus5,5 %

    Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

    Samoihin sairauksiin liittyvät geenit

    Geeniin IVNS1ABP liittyvät piirteet

    Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita IVNS1ABP voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.

    Ulkoiset linkit

    Mistä tiedot ovat peräisin

    • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
    • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
    • GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-19: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
    • ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
    • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
    • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
    • Tietojulkaisu 2026.10.19-9814e911.

    Viittaa tähän sivuun

    APA

    Dante Labs. (n.d.). IVNS1ABP-geeni: influenza virus NS1A binding protein. Haettu 20. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/ivns1abp

    Vancouver

    Dante Labs. IVNS1ABP-geeni: influenza virus NS1A binding protein [Internet]. [viitattu 20. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/ivns1abp

    Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

    Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

    Tilaa Genome Test