Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

TANC2

tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
17q23.2-q23.3
Koordinaadid
Kromosoom 17: 62 966 235–63 427 703 (GRCh38)
Eksonid
28 eksonit, ulatus 461,5 kb
Valk
2074 aminohapet
Tuntud ka kui
DKFZP564D166, FLJ10215, FLJ11824, KIAA1148, KIAA1636, rols, ROLSA
MANE Select transkript
ENST00000689528.1NM_001394998.1
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni TANC2 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas TANC2 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 17, millel on sulg kohal, kus asub TANC2. TANC2 ja sellele lähedal asuvad 21 geeni kromosoomil 17, vahemikus 62 504 766 kuni 63 889 172.Kromosoom 1717q23.2-q23.3p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.362,6 Mb62,8 Mb63 Mb63,2 Mb63,4 Mb63,6 Mb63,8 MbTLK2: 62 458 658–62 615 481, otsene ahelTLK2MRC2: 62 627 417–62 693 597, otsene ahelMRC2MARCHF10: 62 701 314–62 808 344, pöördne ahelMARCHF10TANC2: 62 966 235–63 427 703, otsene ahelTANC2CYB561: 63 432 298–63 447 108, pöördne ahelCYB561ACE: 63 477 058–63 498 380, otsene ahelACE: 63 484 823–63 521 848, otsene ahelKCNH6: 63 523 310–63 548 987, otsene ahelKCNH6DCAF7: 63 550 222–63 594 286, otsene ahelDCAF7: 63 550 603–63 608 347, otsene ahelTACO1: 63 600 879–63 612 023, otsene ahelTACO1MAP3K3: 63 622 379–63 696 310, otsene ahelMAP3K3STRADA: 63 682 336–63 742 005, pöördne ahelSTRADALIMD2: 63 695 883–63 701 183, pöördne ahelLIMD2: 63 702 845–63 752 097, pöördne ahelCCDC47: 63 745 250–63 776 351, pöördne ahelCCDC47DDX42: 63 773 603–63 820 451, otsene ahelDDX42FTSJ3: 63 819 113–63 830 012, pöördne ahelFTSJ3PSMC5: 63 827 082–63 832 244, otsene ahelPSMC5SMARCD2: 63 832 078–63 843 065, pöördne ahelCSH2: 63 872 007–63 873 769, pöördne ahelCSH2GH2: 63 880 205–63 881 970, pöördne ahelGH2TANC2 skeem: 28 eksonit kromosoomi 17 otsene ahelalEkson 7: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 9: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 13: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 14: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 15: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 16: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 17: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 19: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 20: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 25: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 26: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 28: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 62 966 235–62 966 749, 515 alustEkson 2: 63 009 537–63 009 626, 90 alustEkson 3: 63 073 943–63 074 014, 72 alustEkson 4: 63 099 175–63 099 357, 183 alustEkson 5: 63 151 270–63 151 380, 111 alustEkson 6: 63 193 991–63 194 139, 149 alustEkson 7: 63 200 771–63 200 957, 187 alustEkson 8: 63 237 814–63 238 077, 264 alustEkson 9: 63 267 748–63 267 873, 126 alustEkson 10: 63 314 388–63 314 669, 282 alustEkson 11: 63 318 957–63 319 090, 134 alustEkson 12: 63 340 101–63 340 332, 232 alustEkson 13: 63 351 250–63 351 416, 167 alustEkson 14: 63 354 783–63 355 390, 608 alustEkson 15: 63 379 718–63 379 826, 109 alustEkson 16: 63 388 635–63 388 757, 123 alustEkson 17: 63 389 308–63 389 544, 237 alustEkson 18: 63 395 743–63 395 928, 186 alustEkson 19: 63 398 821–63 398 914, 94 alustEkson 20: 63 405 122–63 405 255, 134 alustEkson 21: 63 406 154–63 406 277, 124 alustEkson 22: 63 411 511–63 411 686, 176 alustEkson 23: 63 411 998–63 412 130, 133 alustEkson 24: 63 412 680–63 412 709, 30 alustEkson 25: 63 413 543–63 413 634, 92 alustEkson 26: 63 415 528–63 415 674, 147 alustEkson 27: 63 418 307–63 418 407, 101 alustEkson 28: 63 419 999–63 427 703, 7705 alust11020285′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 12,5 kb kogupikkusega 461,5 kb; neist 6225 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse TANC2

22

kohad geenis TANC2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist 2 (9,1%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

  • Segmental duplications (2 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni TANC2 461,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (12,5 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). TANC2 geen: tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/tanc2

Vancouver

Dante Labs. TANC2 geen: tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/tanc2

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test