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Gene

TANC2

tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
17q23.2-q23.3
Coordinate
Cromosoma 17: 62.966.235–63.427.703 (GRCh38)
Esoni
28 esoni su 461,5 kb
Proteina
2074 amminoacidi
Noto anche come
DKFZP564D166, FLJ10215, FLJ11824, KIAA1148, KIAA1636, rols, ROLSA
Trascritto MANE Select
ENST00000689528.1NM_001394998.1
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora TANC2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di TANC2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 17, con una parentesi dove si trova TANC2. TANC2 e 21 geni nelle vicinanze sul cromosoma 17, da 62.504.766 a 63.889.172.Cromosoma 1717q23.2-q23.3p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.362,6 Mb62,8 Mb63 Mb63,2 Mb63,4 Mb63,6 Mb63,8 MbTLK2: 62.458.658–62.615.481, filamento direttoTLK2MRC2: 62.627.417–62.693.597, filamento direttoMRC2MARCHF10: 62.701.314–62.808.344, filamento inversoMARCHF10TANC2: 62.966.235–63.427.703, filamento direttoTANC2CYB561: 63.432.298–63.447.108, filamento inversoCYB561ACE: 63.477.058–63.498.380, filamento direttoACE: 63.484.823–63.521.848, filamento direttoKCNH6: 63.523.310–63.548.987, filamento direttoKCNH6DCAF7: 63.550.222–63.594.286, filamento direttoDCAF7: 63.550.603–63.608.347, filamento direttoTACO1: 63.600.879–63.612.023, filamento direttoTACO1MAP3K3: 63.622.379–63.696.310, filamento direttoMAP3K3STRADA: 63.682.336–63.742.005, filamento inversoSTRADALIMD2: 63.695.883–63.701.183, filamento inversoLIMD2: 63.702.845–63.752.097, filamento inversoCCDC47: 63.745.250–63.776.351, filamento inversoCCDC47DDX42: 63.773.603–63.820.451, filamento direttoDDX42FTSJ3: 63.819.113–63.830.012, filamento inversoFTSJ3PSMC5: 63.827.082–63.832.244, filamento direttoPSMC5SMARCD2: 63.832.078–63.843.065, filamento inversoCSH2: 63.872.007–63.873.769, filamento inversoCSH2GH2: 63.880.205–63.881.970, filamento inversoGH2Diagramma di TANC2: 28 esoni sul filamento diretto del cromosoma 17Esone 7: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 9: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 13: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 14: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 15: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 16: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 17: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 19: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 20: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 25: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 26: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 28: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 62.966.235–62.966.749, 515 basiEsone 2: 63.009.537–63.009.626, 90 basiEsone 3: 63.073.943–63.074.014, 72 basiEsone 4: 63.099.175–63.099.357, 183 basiEsone 5: 63.151.270–63.151.380, 111 basiEsone 6: 63.193.991–63.194.139, 149 basiEsone 7: 63.200.771–63.200.957, 187 basiEsone 8: 63.237.814–63.238.077, 264 basiEsone 9: 63.267.748–63.267.873, 126 basiEsone 10: 63.314.388–63.314.669, 282 basiEsone 11: 63.318.957–63.319.090, 134 basiEsone 12: 63.340.101–63.340.332, 232 basiEsone 13: 63.351.250–63.351.416, 167 basiEsone 14: 63.354.783–63.355.390, 608 basiEsone 15: 63.379.718–63.379.826, 109 basiEsone 16: 63.388.635–63.388.757, 123 basiEsone 17: 63.389.308–63.389.544, 237 basiEsone 18: 63.395.743–63.395.928, 186 basiEsone 19: 63.398.821–63.398.914, 94 basiEsone 20: 63.405.122–63.405.255, 134 basiEsone 21: 63.406.154–63.406.277, 124 basiEsone 22: 63.411.511–63.411.686, 176 basiEsone 23: 63.411.998–63.412.130, 133 basiEsone 24: 63.412.680–63.412.709, 30 basiEsone 25: 63.413.543–63.413.634, 92 basiEsone 26: 63.415.528–63.415.674, 147 basiEsone 27: 63.418.307–63.418.407, 101 basiEsone 28: 63.419.999–63.427.703, 7705 basi11020285′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 12,5 kb dei 461,5 kb del gene; 6225 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge TANC2

22

posizioni in TANC2 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

2 di esse (9,1%) si trovano in regioni che le letture brevi faticano a leggere.

  • Segmental duplications (2 siti)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Un genoma intero copre tutti i 461,5 kb di TANC2, introni inclusi, non solo i 12,5 kb di esoni.

Tratti collegati a TANC2

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che TANC2 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

Cita questa pagina

APA

Dante Labs. (s.d.). Gene TANC2: tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/tanc2

Vancouver

Dante Labs. Gene TANC2: tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/tanc2

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