Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

AFF3

ALF transcription elongation factor 3

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
2q11.2
Koordinaadid
Kromosoom 2: 99 545 419–100 142 590 (GRCh38)
Eksonid
25 eksonit, ulatus 597,2 kb
Valk
1226 aminohapet
Tuntud ka kui
MLLT2-like
Varasemad tähised
LAF4
MANE Select transkript
ENST00000672756.2NM_001386135.1
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni AFF3 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas AFF3 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 2, millel on sulg kohal, kus asub AFF3. AFF3 ja sellele lähedal asuvad 16 geeni kromosoomil 2, vahemikus 98 948 247 kuni 100 739 762.Kromosoom 22q11.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.399 Mb99,5 Mb100 Mb100,5 MbTSGA10: 98 995 156–99 154 964, pöördne ahelC2orf15: 99 141 235–99 154 585, otsene ahel: 99 141 485–99 322 741, otsene ahelLIPT1: 99 154 955–99 163 199, otsene ahel: 99 154 998–99 195 298, otsene ahelMITD1: 99 161 427–99 181 352, pöördne ahelMITD1MRPL30: 99 181 111–99 224 498, otsene ahelMRPL30LYG2: 99 242 169–99 255 666, pöördne ahelLYG2LYG1: 99 284 238–99 306 110, pöördne ahelLYG1TXNDC9: 99 306 476–99 340 702, pöördne ahelTXNDC9EIF5B: 99 337 361–99 401 326, otsene ahelEIF5BREV1: 99 400 475–99 490 466, pöördne ahelREV1AFF3: 99 545 419–100 142 590, pöördne ahelAFF3LONRF2: 100 271 875–100 322 506, pöördne ahelLONRF2CHST10: 100 391 859–100 417 826, pöördne ahelCHST10NMS: 100 470 482–100 483 280, otsene ahelNMSPDCL3: 100 562 802–100 577 483, otsene ahelPDCL3AFF3 skeem: 25 eksonit kromosoomi 2 pöördne ahelalEkson 18: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 15: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 7: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 25: 99 545 419–99 551 595, 6177 alustEkson 24: 99 554 311–99 554 534, 224 alustEkson 23: 99 554 683–99 554 732, 50 alustEkson 22: 99 558 875–99 558 968, 94 alustEkson 21: 99 560 365–99 560 436, 72 alustEkson 20: 99 565 487–99 565 623, 137 alustEkson 19: 99 568 852–99 568 915, 64 alustEkson 18: 99 578 327–99 578 451, 125 alustEkson 17: 99 582 798–99 582 999, 202 alustEkson 16: 99 587 154–99 587 278, 125 alustEkson 15: 99 593 195–99 594 289, 1095 alustEkson 14: 99 601 435–99 601 621, 187 alustEkson 13: 99 649 626–99 649 666, 41 alustEkson 12: 99 672 538–99 672 589, 52 alustEkson 11: 99 727 077–99 727 128, 52 alustEkson 10: 99 744 104–99 744 140, 37 alustEkson 9: 99 752 221–99 752 301, 81 alustEkson 8: 99 837 477–99 837 524, 48 alustEkson 7: 100 006 632–100 007 017, 386 alustEkson 6: 100 007 148–100 007 460, 313 alustEkson 5: 100 008 812–100 008 932, 121 alustEkson 4: 100 104 402–100 104 518, 117 alustEkson 3: 100 105 504–100 105 583, 80 alustEkson 2: 100 129 224–100 129 306, 83 alustEkson 1: 100 142 484–100 142 590, 107 alust25201510515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 10,1 kb kogupikkusega 597,2 kb; neist 3681 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse AFF3

6

kohad geenis AFF3, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni AFF3 597,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (10,1 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). AFF3 geen: ALF transcription elongation factor 3. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/aff3

Vancouver

Dante Labs. AFF3 geen: ALF transcription elongation factor 3 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/aff3

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test