Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA

Gen

LITAF

lipopolysaccharide induced TNF factor

Shrnutí

Cytogenetická poloha
16p13.13
Souřadnice
Chromozom 16: 11 547 722–11 586 919 (GRCh38)
Exony
4 exonů na 39,2 kb
Protein
161 aminokyselin
Další názvy
PIG7, SIMPLE, FLJ38636, TP53I7
Transkript MANE Select
ENST00000622633.5NM_001136472.2
Typ lokusu
gene with protein product
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Referenční genomGRCh38

Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.

Kurátorovaný report související s tímto genem

    • Charcot-Marie-Tooth Disease

      • Jeden z 62 genů spojených s touto vazbou

        A group of inherited peripheral neuropathies causing progressive weakness and wasting of the distal muscles and loss of sensation, mainly in the feet and hands.

        • Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
        • 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
        Co přináší znalost

        Genetic counseling, subtype-specific monitoring, physical therapy, orthotics, neurotoxic drug avoidance, gene-specific clinical trials, surveillance for associated features

    Jak je LITAF uspořádán

    • Kódující sekvence
    • Netranslatovaná oblast
    • Intron
    • Směr transkripce
    • Známá místa způsobující onemocnění
    • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
    Chromozom 16, se závorkou u LITAF. LITAF a 16 genů poblíž na chromozomu 16, od 11 067 321 do 12 067 320.Chromozom 1616p13.13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.311,2 Mb11,4 Mb11,6 Mb11,8 Mb12 MbCLEC16A: 10 944 508–11 189 745, řetězec dopřednémCLEC16ASOCS1: 11 246 400–11 256 556, řetězec zpětnémRMI2: 11 249 619–11 381 662, řetězec dopřednémRMI2TNP2: 11 267 748–11 269 533, řetězec zpětnémPRM3: 11 273 199–11 273 629, řetězec zpětnémPRM3PRM2: 11 275 632–11 276 488, řetězec zpětnémPRM2PRM1: 11 280 836–11 281 398, řetězec zpětnémPRM1APOLTP: 11 359 845–11 527 247, řetězec zpětnémAPOLTPLITAF: 11 547 722–11 586 919, řetězec zpětnémLITAFSNN: 11 668 027–11 679 164, řetězec dopřednémSNNTXNDC11: 11 679 073–11 743 703, řetězec zpětnémTXNDC11ZC3H7A: 11 750 586–11 797 263, řetězec zpětnémZC3H7ARSL1D1: 11 833 850–11 851 586, řetězec zpětnémRSL1D1GSPT1: 11 868 128–11 916 082, řetězec zpětnémGSPT1NPIPB2: 11 927 259–11 976 643, řetězec zpětnémNPIPB2TNFRSF17: 11 965 138–11 968 068, řetězec dopřednémTNFRSF17SNX29: 11 976 694–12 574 287, řetězec dopřednémSNX29Schéma LITAF: 4 exonů na zpětném řetězci chromozomu 16Exon 4: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 3: 4 známých míst způsobujících onemocněníExon 4: 11 547 722–11 549 745, 2 024 bázíExon 3: 11 553 533–11 553 689, 157 bázíExon 2: 11 556 511–11 556 735, 225 bázíExon 1: 11 586 886–11 586 919, 34 bází43215′3′

    Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

    Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

    Exony tvoří 2,4 kb z 39,2 kb genu; 486 těchto bází kódují protein.

    Jak genetický test čte LITAF

    5

    pozic v genu LITAF, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní

    Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.

    Celý genom pokrývá všech 39,2 kb genu LITAF, včetně intronů, nikoli jen 2,4 kb exonů.

    Odkud údaje pocházejí

    • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
    • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
    • GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
    • Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
    • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
    • Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
    • Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citovat tuto stránku

    APA

    Dante Labs. (b.d.). Gen LITAF: lipopolysaccharide induced TNF factor. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/litaf

    Vancouver

    Dante Labs. Gen LITAF: lipopolysaccharide induced TNF factor [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/litaf

    Jeden test. Odpovědi na celý život.

    Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

    Objednejte si Genome Test