Gen
SLC3A1
solute carrier family 3 member 1
- HGNC 11025↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000138079↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6519↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 2p21
- Koordinater
- Kromosom 2: 44 275 480–44 321 494 (GRCh38)
- Exoner
- 10 exoner på 46 kb
- Protein
- 685 aminosyror
- Även känd som
- CSNU1, D2H, RBAT, ATR1, NBAT
- MANE Select-transkript
- ENST00000260649.11NM_000341.4
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc3a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SLC3A1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Cystinuri
Cystinuri är en rubbning i njurarnas tubulära transport av aminosyror som kännetecknas av återkommande bildning av cystinstenar i njurarna.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är SLC3A1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3 kb av genens 46 kb, och 2 058 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SLC3A1
91
positioner i SLC3A1 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.
En helgenomsekvensering täcker alla 46 kb av SLC3A1, inklusive introner, och inte bara de 3 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
Egenskaper kopplade till SLC3A1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SLC3A1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SLC3A1-genen: solute carrier family 3 member 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/slc3a1
Dante Labs. SLC3A1-genen: solute carrier family 3 member 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/slc3a1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor