Gen
SLC25A11
solute carrier family 25 member 11
- HGNC 10981↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000108528↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 8402↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 17p13.2
- Współrzędne
- Chromosom 17: 4 937 130–4 940 046 (GRCh38)
- Eksony
- 8 eksonów na odcinku 2,9 kb
- Białko
- 314 aminokwasów
- Znany również jako
- OGC
- Poprzednie symbole
- SLC20A4
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000225665.12NM_003562.5
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc25a11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj SLC25A11 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu SLC25A11. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.
Budowa genu SLC25A11
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,7 kb z 2,9 kb genu; 945 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie SLC25A11
2Łatwe
Stopień trudności sekwencjonowania SLC25A11 krótkimi odczytami, w skali do 100
0 · Łatwe100 · Trudne
Niemal wszystkie eksony SLC25A11 leżą w miejscach, gdzie krótkie odczyty dopasowują się jednoznacznie.
Co na to wpływa: udział eksonów SLC25A11 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćOdcinki, w których odczytów 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wykryta tam zmiana może być niepełna lub błędna. Waga: 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentowe: kopie w innych częściach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga: 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga: 15%.4,7%
- Zawartość GCOkna z poniżej 25% lub powyżej 65% G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga: 10%.14%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, w których brak sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga: 10%.0%
Wynik Dante Labs oparty na naszych własnych badaniach, zbudowany na mapach trudnych do sekwencjonowania regionów Genome in a Bottle instytutu NIST.Jak to jest ocenianeKażdy słupek to udział zasad eksonów SLC25A11 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je według tego, o ile każda z nich utrudnia wywołanie zmiany przez krótkie odczyty: 0, gdy żadna zasada nie leży w żadnym takim regionie, 100, gdy każda zasada leży we wszystkich.
Cechy powiązane z genem SLC25A11
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SLC25A11. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SLC25A11: solute carrier family 25 member 11. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/slc25a11
Dante Labs. Gen SLC25A11: solute carrier family 25 member 11 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/slc25a11
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni