Gen
HPS5
HPS5 biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 2
- HGNC 17022↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000110756↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 11234↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 11p15.1
- Koordinater
- Kromosom 11: 18 278 676–18 322 140 (GRCh38)
- Eksoner
- 23 eksoner over 43,5 kb
- Protein
- 1 129 aminosyrer
- Arvelighet
- Autosomal recessiv
- Også kjent som
- BLOC2S2, AIBP63, RU2
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000349215.8NM_181507.2
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les HPS5 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Hermansky-Pudlaks syndrom
- Autosomal recessiv
Hermansky-Pudlaks syndrom (HPS) er en tilstand som rammer flere organsystemer og er kjennetegnet av okulokutan albinisme, blødningstendens og i noen tilfeller nøytropeni, lungefibrose eller granulomatøs kolitt. HPS omfatter åtte kjente tilstander (HPS-1 til HPS-8), og de fleste av dem gir det samme kliniske bildet, i varierende grad av alvorlighet.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Arv
- Autosomal recessiv
- Det kreves en endret kopi fra hver forelder. Med én er du bærer og vanligvis uten sykdom. Når begge foreldrene er bærere, har hvert barn en sjanse på én av fire til å arve to.
Slik er HPS5 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 4,8 kb av genets 43,5 kb, og 3 390 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test HPS5
28
posisjoner i HPS5 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 43,5 kb av HPS5, inkludert introner, og ikke bare de 4,8 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- AP3B1adaptor related protein complex 3 subunit beta 1Deler 1 tilstand
- AP3D1adaptor related protein complex 3 subunit delta 1Deler 1 tilstand
- BLOC1S3biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 3Deler 1 tilstand
- BLOC1S5biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 5Deler 1 tilstand
- BLOC1S6biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 6Deler 1 tilstand
- DTNBP1dystrobrevin binding protein 1Deler 1 tilstand
- HPS1HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1Deler 1 tilstand
- HPS3HPS3 biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1Deler 1 tilstand
- HPS4HPS4 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2Deler 1 tilstand
- HPS6HPS6 biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til HPS5
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene HPS5 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). HPS5-genet: HPS5 biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/hps5
Dante Labs. HPS5-genet: HPS5 biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 2 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/hps5
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker