Gen
NUP205
nucleoporin 205
- HGNC 18658↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000155561↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 23165↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 7q33
- Coördinaten
- Chromosoom 7: 135.557.917–135.648.753 (GRCh38)
- Exons
- 43 exons over 90,8 kb
- Eiwit
- 2.012 aminozuren
- Ook bekend als
- KIAA0225
- Eerdere symbolen
- C7orf14
- MANE Select-transcript
- ENST00000285968.11NM_015135.3
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nup205.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees NUP205 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Nefrotisch syndroom
- Nefrose
Pathologische processen van de NIER zonder ontstekings- of tumorcomponenten. Nefrose kan een primaire aandoening zijn of een secundaire complicatie van andere ziekten. Het wordt gekenmerkt door het NEFROTISCH SYNDROOM, wat wijst op de aanwezigheid van PROTEÏNURIE en HYPOALBUMINEMIE met bijbehorend OEDEEM.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Opbouw van NUP205
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 6,3 kb van de 90,8 kb van het gen; 6.039 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van NUP205
0Laag
Hoe moeilijk NUP205 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100Elke balk is het aandeel van de exonbasen van NUP205 in dat type moeilijke regio. De score weegt deze naar hoeveel elk een short-read-call kost: 0 wanneer geen enkele base in een van deze regio's valt, 100 wanneer elke base in alle regio's valt.
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek geplaatst kunnen worden, waardoor een call daar kan ontbreken of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen schuiven en die ze mogelijk niet overbruggen. Gewicht 15%.0,6%
- GC-gehalteVensters onder 25% of boven 65% G en C, die de bibliotheekvoorbereiding slechts dun dekt. Gewicht 10%.0,7%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentieassemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Gewicht 10%.0%
1
positie in NUP205 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen ervan valt in een gebied dat korte reads lastig vinden.
Een volledig genoom dekt alle 90,8 kb van NUP205, inclusief intronen, en niet alleen de 6,3 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ACTN4actinin alpha 4Deelt 1 aandoening
- ARHGDIARho GDP dissociation inhibitor alphaDeelt 1 aandoening
- COQ6coenzyme Q6, monooxygenaseDeelt 1 aandoening
- COQ8Bcoenzyme Q8BDeelt 1 aandoening
- DAAM2dishevelled associated activator of morphogenesis 2Deelt 1 aandoening
- DGKEdiacylglycerol kinase epsilonDeelt 1 aandoening
- DLC1DLC1 Rho GTPase activating proteinDeelt 1 aandoening
- EMP2epithelial membrane protein 2Deelt 1 aandoening
- ITSN1intersectin 1Deelt 1 aandoening
- ITSN2intersectin 2Deelt 1 aandoening
- KANK2KN motif and ankyrin repeat domains 2Deelt 1 aandoening
- LAMA5laminin subunit alpha 5Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan NUP205
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die NUP205 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-17: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). NUP205-gen: nucleoporin 205. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/nup205
Dante Labs. NUP205-gen: nucleoporin 205 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/nup205
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken