Gene
CTPS1
CTP synthase 1
- HGNC 2519↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000171793↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 1503↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 1p34.2
- Coordinate
- Cromosoma 1: 40.979.696–41.012.565 (GRCh38)
- Esoni
- 19 esoni su 32,9 kb
- Proteina
- 591 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Noto anche come
- GATD5A
- Simboli precedenti
- CTPS
- Trascritto MANE Select
- ENST00000650070.2NM_001905.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Immunodeficienza combinata grave
- Immunodeficienza combinata grave da deficit di CTPS1Autosomica recessiva
L'immunodeficienza combinata grave (SCID) da deficit di CTPS1 è una rara immunodeficienza primaria causata dalla ridotta capacità di proliferazione delle cellule T e B attivate in risposta alla stimolazione mediata dai recettori antigenici. È caratterizzata da infezioni virali a esordio precoce, gravi, persistenti e/o ricorrenti provocate dal virus di Epstein-Barr (EBV) e dal virus della varicella-zoster (VZV) (compresa la varicella generalizzata), nonché da infezioni batteriche rinosinusali e polmonari ricorrenti dovute a patogeni capsulati.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Raggruppamenti più ampi
Altri errori innati dell'immunità
- Malattia da immunodeficienza
Uno di 170 geni collegati ad esso
Malattia caratterizzata da un deficit o da un'anomalia nei meccanismi dell'immunità, sia essa cellulare o umorale.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
HSCT per SCID e PID gravi; terapia sostitutiva con immunoglobuline (IVIG/SCIG) per i deficit anticorpali; leniolisib (Joenja, FDA 2023) per APDS; terapia genica per ADA-SCID; abatacept per il deficit di CTLA4/LRBA; profilassi antibiotica; G-CSF per CGD
Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di CTPS1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 2,8 kb dei 32,9 kb del gene; 1776 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge CTPS1
1
posizione in CTPS1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 32,9 kb di CTPS1, introni inclusi, non solo i 2,8 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ADAadenosine deaminaseCondivide 1 condizione
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseCondivide 1 condizione
- AK2adenylate kinase 2Condivide 1 condizione
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BCondivide 1 condizione
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Condivide 1 condizione
- ATMATM serine/threonine kinaseCondivide 1 condizione
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Condivide 1 condizione
- B2Mbeta-2-microglobulinCondivide 1 condizione
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Condivide 1 condizione
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorCondivide 1 condizione
- BCL11BBCL11 transcription factor BCondivide 1 condizione
- BLNKB cell linkerCondivide 1 condizione
Tratti collegati a CTPS1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che CTPS1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene CTPS1: CTP synthase 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ctps1
Dante Labs. Gene CTPS1: CTP synthase 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ctps1
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