Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

HMGB1

high mobility group box 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
13q12.3
Koordinaadid
Kromosoom 13: 30 456 704–30 465 936 (GRCh38)
Eksonid
5 eksonit, ulatus 9,2 kb
Valk
215 aminohapet
Tuntud ka kui
HMG3, SBP-1, DKFZp686A04236
Varasemad tähised
HMG1
MANE Select transkript
ENST00000341423.10NM_002128.7
Lookuse tüüp
Protein-coding
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni HMGB1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas HMGB1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 13, millel on sulg kohal, kus asub HMGB1. HMGB1 ja sellele lähedal asuvad 6 geeni kromosoomil 13, vahemikus 29 961 320 kuni 30 961 319.Kromosoom 1313q12.3p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3430 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 MbKATNAL1: 30 202 630–30 307 554, pöördne ahelKATNAL1UBE2L5: 30 422 488–30 429 758, otsene ahelUBE2L5HMGB1: 30 456 704–30 465 936, pöördne ahelHMGB1USPL1: 30 617 693–30 660 770, otsene ahelUSPL1ALOX5AP: 30 713 478–30 765 072, otsene ahelALOX5APMEDAG: 30 906 200–30 925 574, otsene ahelMEDAGTEX26: 30 932 639–30 982 522, otsene ahelTEX26HMGB1 skeem: 5 eksonit kromosoomi 13 pöördne ahelalEkson 5: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 4: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 5: 30 456 704–30 461 533, 4830 alustEkson 4: 30 462 538–30 462 712, 175 alustEkson 3: 30 463 207–30 463 352, 146 alustEkson 2: 30 463 531–30 463 694, 164 alustEkson 1: 30 465 796–30 465 936, 141 alust543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 5,5 kb kogupikkusega 9,2 kb; neist 648 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: HMGB1

2

HMGB1 positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist 2 (100%) asuvad piirkondades, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.

  • Low mappability (1 koht)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 koht)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Terve genoom katab kogu HMGB1 geeni 9,2 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 5,5 kb eksoneid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). HMGB1 geen: high mobility group box 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/hmgb1

Vancouver

Dante Labs. HMGB1 geen: high mobility group box 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/hmgb1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test