Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA

Gen

HMGB1

high mobility group box 1

Shrnutí

Cytogenetická poloha
13q12.3
Souřadnice
Chromozom 13: 30 456 704–30 465 936 (GRCh38)
Exony
5 exonů na 9,2 kb
Protein
215 aminokyselin
Další názvy
HMG3, SBP-1, DKFZp686A04236
Předchozí symboly
HMG1
Transkript MANE Select
ENST00000341423.10NM_002128.7
Typ lokusu
gene with protein product
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Referenční genomGRCh38

Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen HMGB1. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je HMGB1 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Známá místa způsobující onemocnění
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 13, se závorkou u HMGB1. HMGB1 a 6 genů poblíž na chromozomu 13, od 29 961 320 do 30 961 319.Chromozom 1313q12.3p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3430 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 MbKATNAL1: 30 202 630–30 307 554, řetězec zpětnémKATNAL1UBE2L5: 30 422 488–30 429 758, řetězec dopřednémUBE2L5HMGB1: 30 456 704–30 465 936, řetězec zpětnémHMGB1USPL1: 30 617 693–30 660 770, řetězec dopřednémUSPL1ALOX5AP: 30 713 478–30 765 072, řetězec dopřednémALOX5APMEDAG: 30 906 200–30 925 574, řetězec dopřednémMEDAGTEX26: 30 932 639–30 982 522, řetězec dopřednémTEX26Schéma HMGB1: 5 exonů na zpětném řetězci chromozomu 13Exon 5: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 4: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 5: 30 456 704–30 461 533, 4 830 bázíExon 4: 30 462 538–30 462 712, 175 bázíExon 3: 30 463 207–30 463 352, 146 bázíExon 2: 30 463 531–30 463 694, 164 bázíExon 1: 30 465 796–30 465 936, 141 bází543215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 5,5 kb z 9,2 kb genu; 648 těchto bází kódují protein.

Jak genetický test čte HMGB1

2

pozic v genu HMGB1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Z nich 2 (100 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.

  • Low mappability (1 místo)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 místo)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Celý genom pokrývá všech 9,2 kb genu HMGB1, včetně intronů, nikoli jen 5,5 kb exonů.

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
  • Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen HMGB1: high mobility group box 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/hmgb1

Vancouver

Dante Labs. Gen HMGB1: high mobility group box 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/hmgb1

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test